More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1244 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1244  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
260 aa  513  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.640611  normal  0.046389 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7065  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.69 
 
 
253 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3640  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.86 
 
 
256 aa  215  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1906  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.9 
 
 
256 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223556  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 
257 aa  131  9e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.94 
 
 
273 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  31.89 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.64 
 
 
266 aa  128  8.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  31.15 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0654  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.81 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  34.86 
 
 
257 aa  126  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  34.86 
 
 
257 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  35.22 
 
 
251 aa  126  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.92 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.57 
 
 
252 aa  125  5e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
268 aa  125  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 
266 aa  124  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  31.92 
 
 
257 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 
259 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.48 
 
 
255 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 
262 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  30.15 
 
 
262 aa  123  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  34.15 
 
 
265 aa  122  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  34.84 
 
 
258 aa  122  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.15 
 
 
259 aa  122  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.79 
 
 
257 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.37 
 
 
255 aa  122  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.89 
 
 
260 aa  122  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  34.84 
 
 
258 aa  122  8e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  30.77 
 
 
283 aa  122  8e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
261 aa  122  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.39 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.09 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  37.93 
 
 
263 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.1 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.39 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1147  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.46 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.25 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  33.74 
 
 
259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4606  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.41 
 
 
257 aa  119  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.3 
 
 
259 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  32.26 
 
 
264 aa  119  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.51 
 
 
257 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.35 
 
 
258 aa  118  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.63 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.92 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.89 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  28.79 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3055  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.8 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  29.62 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.23 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2705  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.59 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.65 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  35.09 
 
 
265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0212  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.01 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  32.13 
 
 
257 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09128  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01210)  33.61 
 
 
271 aa  115  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.08 
 
 
260 aa  115  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  30.53 
 
 
258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  31.13 
 
 
257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 
264 aa  115  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.71 
 
 
258 aa  115  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  30.2 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  31.87 
 
 
270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.83 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.84 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.77 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.13 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.89 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  32.66 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  30.04 
 
 
277 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  30.74 
 
 
257 aa  113  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  32.53 
 
 
257 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  33.49 
 
 
257 aa  113  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  30 
 
 
258 aa  113  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  33.06 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.64 
 
 
267 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.15 
 
 
261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  31.05 
 
 
257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2905  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.54 
 
 
256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.433912  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.08 
 
 
256 aa  112  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.17 
 
 
259 aa  112  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.01 
 
 
258 aa  112  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  35.15 
 
 
270 aa  112  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  32.27 
 
 
275 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
257 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.64 
 
 
259 aa  112  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.19 
 
 
260 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.52 
 
 
259 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  32.67 
 
 
270 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>