288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1192 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1192  Gluconate transporter  100 
 
 		 476 aa  885    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.423726  normal  0.434711 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2847  Gluconate transporter  57.54 
 
 		 447 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0190  Gluconate transporter  44.59 
 
 		 481 aa  344  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1715  Gluconate transporter  42.86 
 
 		 496 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245438  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2333  Gluconate transporter  32.99 
 
 		 468 aa  158  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.626027  normal  0.197447 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  27.82 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0895  gluconate transporter  30.02 
 
 		 461 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000913428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  26.64 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4021  high-affinity gluconate transporter GntT  26.64 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0135  gluconate transporter  26.64 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  26.55 
 
 		 438 aa  141  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  30.07 
 
 		 498 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  30.07 
 
 		 498 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  30.07 
 
 		 498 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3102  gluconate transporter GntP  30.07 
 
 		 498 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3222  hypothetical protein  30.07 
 
 		 498 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1025  gluconate transporter  25.36 
 
 		 452 aa  138  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0156  gluconate permease  27.02 
 
 		 448 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0207  gluconate permease  27.02 
 
 		 448 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0165  gluconate permease  27.02 
 
 		 448 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0158  gluconate permease  27.02 
 
 		 448 aa  137  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0163  gluconate permease  27.02 
 
 		 448 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4787  gluconate transporter  32.7 
 
 		 465 aa  137  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0185  gluconate permease  27.02 
 
 		 448 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2187  gluconate transporter  28.66 
 
 		 460 aa  137  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3175  gluconate transporter  29.81 
 
 		 462 aa  136  9e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04131  L-idonate and D-gluconate transporter  27.9 
 
 		 439 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3732  gluconate transporter  27.9 
 
 		 439 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04095  hypothetical protein  27.9 
 
 		 439 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4746  Gnt-II system L-idonate transporter  27.9 
 
 		 439 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.618535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4521  Gnt-II system L-idonate transporter  27.9 
 
 		 439 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00247449  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  26.42 
 
 		 438 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0464  Gluconate transporter  28.54 
 
 		 446 aa  134  5e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2778  gluconate transporter  28.63 
 
 		 452 aa  134  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.111665 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2713  gluconate transporter  28.36 
 
 		 452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1438  gluconate transporter  30.8 
 
 		 455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03267  gluconate transporter, high-affinity GNT I system  28.63 
 
 		 438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0298  gluconate transporter  28.63 
 
 		 438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000270945  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3796  high-affinity gluconate transporter  28.63 
 
 		 438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3696  high-affinity gluconate transporter  28.63 
 
 		 438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.590418 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3613  high-affinity gluconate transporter  28.63 
 
 		 438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3891  high-affinity gluconate transporter  28.63 
 
 		 438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0298  gluconate transporter  28.63 
 
 		 438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000171105  normal  0.0267385 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03219  hypothetical protein  28.63 
 
 		 438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000216048  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4722  high-affinity gluconate transporter  28.63 
 
 		 438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0207  GntP family permease  28.44 
 
 		 451 aa  130  7.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000342719  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2533  gluconate transporter  27.14 
 
 		 452 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0223  gluconate transporter  27.47 
 
 		 439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2104  gluconate transporter  25.81 
 
 		 455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3786  high-affinity gluconate transporter  27.84 
 
 		 438 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  25.65 
 
 		 452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4651  gluconate transporter  26.73 
 
 		 438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  26.11 
 
 		 452 aa  129  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  26.11 
 
 		 452 aa  129  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3820  high-affinity gluconate transporter  27.84 
 
 		 438 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.832032 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3711  high-affinity gluconate transporter  27.62 
 
 		 438 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4737  transporter gluconate:H+ symporter (GntP) family  27.93 
 
 		 439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.137331 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3133  gluconate transporter  27.71 
 
 		 452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0146  Gluconate transporter  24.58 
 
 		 460 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000250826  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3714  high-affinity gluconate transporter  27.62 
 
 		 438 aa  128  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4767  transporter, gluconate:H+ symporter (GntP) family  28.11 
 
 		 439 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0776084  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4830  gluconate:H+ symporter (hypothetical protein) family transporter  28.11 
 
 		 463 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.742324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3882  high-affinity gluconate transporter  27.62 
 
 		 438 aa  128  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4886  gluconate:H+ symporter family transporter  28.11 
 
 		 439 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4867  gluconate:H+ symporter family protein  28.11 
 
 		 463 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.147551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3262  Gluconate transporter  27.93 
 
 		 482 aa  127  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  normal  0.0187026 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  27.19 
 
 		 449 aa  126  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02275  predicted transporter  27.33 
 
 		 445 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  31.51 
 
 		 464 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1292  gluconate transporter  27.33 
 
 		 445 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2515  permease DsdX  27.71 
 
 		 445 aa  126  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.873662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1304  permease DsdX  27.33 
 
 		 445 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.478606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2502  permease DsdX  27.33 
 
 		 445 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.667372  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3703  gluconate transporter  25.58 
 
 		 448 aa  126  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.900144  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02236  hypothetical protein  27.33 
 
 		 445 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  26.89 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2772  Gluconate transporter  28.39 
 
 		 452 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000382691 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1605  gluconate transporter  28.39 
 
 		 452 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0591  Na+/gluconate symporter, GntP  26.85 
 
 		 465 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0611  GntT protein  25.6 
 
 		 462 aa  124  3e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  28.26 
 
 		 477 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1571  gluconate transporter  28.39 
 
 		 452 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486424  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1576  gluconate transporter  28.39 
 
 		 452 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0728  gluconate transporter  25.96 
 
 		 461 aa  124  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000179796  normal  0.654044 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  28.73 
 
 		 464 aa  123  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4189  permease DsdX  27.12 
 
 		 445 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4010  permease DsdX  27.12 
 
 		 445 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4026  permease DsdX  27.12 
 
 		 445 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2641  gluconate transporter  27.2 
 
 		 452 aa  123  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  26.79 
 
 		 450 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24190  gluconate transporter  29.91 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.456069  normal  0.0307448 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1771  GntP family permease  29.38 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4131  permease DsdX  27.12 
 
 		 445 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0918369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  26.79 
 
 		 450 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0685  gluconate transporter  26.91 
 
 		 461 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0925038  normal  0.0301059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  27.22 
 
 		 450 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6829  gluconate transporter  28.96 
 
 		 469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  27.02 
 
 		 450 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4081  permease DsdX  27.12 
 
 		 445 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3111  gluconate transporter  28.57 
 
 		 447 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>