56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0995 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0995  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 394 aa  728    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1989  major facilitator transporter  39.04 
 
 		 392 aa  189  9e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143925  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0104  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 		 391 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2468  major facilitator superfamily MFS_1  38.29 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2641  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 396 aa  97.1  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2048  major facilitator superfamily transporter  28.44 
 
 		 366 aa  94.4  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424567  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0816  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 450 aa  87.4  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.678777  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1776  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3303  major facilitator superfamily transporter  27.32 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.176544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4736  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1372  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2488  major facilitator superfamily transporter  26.54 
 
 		 395 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0416147 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0960  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3076  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2167  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215044  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1515  putative inner membrane efflux protein  30.58 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.158169 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1316  major facilitator transporter  22.37 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000106102 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0190  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 403 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2071  major facilitator superfamily transporter  26.11 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490774 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 396 aa  50.8  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 395 aa  50.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 416 aa  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  24.88 
 
 		 390 aa  49.7  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 384 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  25.45 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  25.34 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  25.45 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6677  hypothetical protein  28.85 
 
 		 428 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  25.34 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1355  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.358064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  23.04 
 
 		 392 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  25.48 
 
 		 390 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0813  class H tetracycline resistance efflux protein  24.52 
 
 		 449 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 439 aa  47  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 461 aa  46.6  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3692  general substrate transporter  28.71 
 
 		 430 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0263  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 		 367 aa  46.6  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  25.61 
 
 		 392 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2498  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 429 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 458 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  24.8 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  24.52 
 
 		 384 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  26.62 
 
 		 492 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 405 aa  43.5  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 487 aa  43.9  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 		 413 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2302  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 404 aa  42.7  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>