221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0367 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0367  protein of unknown function DUF179  100 
 
 		 192 aa  370  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2389  hypothetical protein  57.67 
 
 		 198 aa  217  7.999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.468382  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0924  hypothetical protein  52.41 
 
 		 193 aa  191  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3882  protein of unknown function DUF179  48.94 
 
 		 191 aa  174  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1710  hypothetical protein  50.53 
 
 		 192 aa  173  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  48.15 
 
 		 198 aa  166  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1179  protein of unknown function DUF179  47.4 
 
 		 184 aa  164  6.9999999999999995e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0188247  normal  0.235234 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1471  hypothetical protein  49.74 
 
 		 205 aa  161  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1704  hypothetical protein  45.83 
 
 		 208 aa  158  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  hitchhiker  0.00529814 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7076  hypothetical protein  45.45 
 
 		 193 aa  150  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39570  hypothetical protein  45.99 
 
 		 198 aa  147  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.336935 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1289  hypothetical protein  46.11 
 
 		 191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0923  hypothetical protein  44.5 
 
 		 196 aa  144  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0723  hypothetical protein  44.21 
 
 		 196 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0987  hypothetical protein  44.27 
 
 		 196 aa  141  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10037  hypothetical protein  41.4 
 
 		 202 aa  131  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.739012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5392  hypothetical protein  41.27 
 
 		 204 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.891404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5481  hypothetical protein  41.27 
 
 		 204 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478764  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5768  hypothetical protein  41.27 
 
 		 204 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0850  hypothetical protein  41.27 
 
 		 204 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6057  hypothetical protein  40.86 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.229198  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4219  protein of unknown function DUF179  39.25 
 
 		 209 aa  128  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5395  hypothetical protein  40.32 
 
 		 190 aa  127  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5076  protein of unknown function DUF179  44.21 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4833  protein of unknown function DUF179  37.63 
 
 		 225 aa  115  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0922435  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  35.03 
 
 		 188 aa  111  7.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  38.17 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  33.67 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  33.5 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  37.63 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  34.01 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  32.83 
 
 		 187 aa  101  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  34.38 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1773  transcriptional regulator  29.02 
 
 		 182 aa  94.4  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  33.5 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  31.25 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  31.09 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  31.18 
 
 		 216 aa  85.5  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1432  protein of unknown function DUF179  30.17 
 
 		 188 aa  85.5  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.914919  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3631  hypothetical protein  31.94 
 
 		 184 aa  85.1  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  27.81 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0413  hypothetical protein  33.89 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  34.62 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  32.08 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  28.27 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  28.42 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_002620  TC0483  hypothetical protein  30.85 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.195339  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  28.21 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  27.17 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  27.96 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  29.71 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1574  hypothetical protein  30.9 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297031  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4348  hypothetical protein  31.28 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  30.41 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1286  hypothetical protein  27.27 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  26.18 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4502  hypothetical protein  30.93 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  31.22 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2193  transcriptional regulator  30 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.996839  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0140  hypothetical protein  24.87 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  28.34 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2850  hypothetical protein  26.06 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2219  hypothetical protein  30 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277771  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  27.87 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  27.37 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0726  hypothetical protein  30.98 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  28.96 
 
 		 189 aa  72  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6966  hypothetical protein  28.65 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  28.18 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  31.38 
 
 		 210 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1337  hypothetical protein  27.51 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0174957  hitchhiker  0.000402511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  25.52 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0788  hypothetical protein  29.02 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  29.79 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  27.17 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  30.85 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  28.19 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  30.85 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1764  protein of unknown function DUF179  29.53 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.619647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  29.12 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  26.32 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2752  hypothetical protein  30.05 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  29.1 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  24.23 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3034  hypothetical protein  27.27 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000468613  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  26.88 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  29.23 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  27.27 
 
 		 187 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  27.27 
 
 		 187 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  30.46 
 
 		 195 aa  67  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3019  hypothetical protein  27.27 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00383877  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  30.77 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  28.34 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  28.57 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  29.41 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09628  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.770481  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  30.11 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3439  hypothetical protein  29.89 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.623694  hitchhiker  0.00691193 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3343  hypothetical protein  29.89 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.329323 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3352  hypothetical protein  29.48 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0115365  decreased coverage  0.00224252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>