More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3349 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
257 aa  509  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.22 
 
 
257 aa  330  2e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3954  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.95 
 
 
258 aa  317  1e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0540156  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.8 
 
 
257 aa  304  9.000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.9 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.62 
 
 
255 aa  239  4e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.255887  normal  0.188153 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
255 aa  223  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229427  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.36 
 
 
257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00570  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  44.57 
 
 
267 aa  201  8e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000200385  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28720  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  47.98 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.382061  normal  0.0594101 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.12 
 
 
249 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.63 
 
 
253 aa  191  8e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.31 
 
 
249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.519285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
249 aa  185  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458004  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 
254 aa  185  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 
249 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.67 
 
 
249 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0450975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.67 
 
 
249 aa  179  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.120513 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.35 
 
 
248 aa  176  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3267  putative short chain dehydrogenase/reductase  44.53 
 
 
249 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4775  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
249 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 
254 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
249 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.504822  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
251 aa  169  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.780011 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4414  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.05 
 
 
249 aa  168  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0509  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.65 
 
 
245 aa  167  1e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
247 aa  164  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  normal  0.265032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
247 aa  164  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
247 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
282 aa  162  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458273  normal  0.643271 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 
249 aa  162  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
246 aa  161  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2721  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.13 
 
 
249 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
247 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.5 
 
 
249 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.459436  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2001  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.84 
 
 
245 aa  159  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 
256 aa  159  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 
249 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 
249 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7095  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
252 aa  158  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
249 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 
247 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
249 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.77933  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.98 
 
 
247 aa  155  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.47 
 
 
249 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
249 aa  153  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1665  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.13 
 
 
247 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139434  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0732  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
249 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1671  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.5 
 
 
246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1549  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.2 
 
 
256 aa  150  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.755021  normal  0.0732126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 
282 aa  150  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2255  acetoacetyl-CoA reductase  37.2 
 
 
240 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
268 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1719  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.37 
 
 
249 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1120  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.05 
 
 
249 aa  149  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3449  acetoacetyl-CoA reductase  36.25 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0871838  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465819 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.31 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0999  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.76 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
233 aa  146  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.45 
 
 
246 aa  145  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282314 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0532  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.94 
 
 
249 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2804  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.94 
 
 
249 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2477  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.94 
 
 
249 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  36.25 
 
 
252 aa  145  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2905  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.94 
 
 
249 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.901799  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2790  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.94 
 
 
249 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570924  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2851  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.94 
 
 
249 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238755  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1003  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.44 
 
 
249 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1800  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.94 
 
 
249 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1505  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.76 
 
 
244 aa  144  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0160485  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1647  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.76 
 
 
247 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00240946  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1074  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.8 
 
 
249 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
253 aa  143  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0429944  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.15 
 
 
260 aa  143  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
246 aa  143  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3832  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.76 
 
 
247 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589853  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
241 aa  143  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00191799  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1320  acetyacetyl-CoA reductase  36.14 
 
 
246 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0653328  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.65 
 
 
245 aa  143  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.67 
 
 
260 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11168  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2329  acetyacetyl-CoA reductase  36.14 
 
 
248 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2257  acetyacetyl-CoA reductase  36.14 
 
 
260 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153797  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1809  acetyacetyl-CoA reductase  36.14 
 
 
246 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0410945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2201  acetyacetyl-CoA reductase  36.14 
 
 
246 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0378854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0087  acetyacetyl-CoA reductase  36.14 
 
 
246 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1080  acetyacetyl-CoA reductase  36.14 
 
 
246 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
244 aa  143  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2910  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.8 
 
 
249 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26924  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2164  acetyacetyl-CoA reductase  36.14 
 
 
246 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456725  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 
246 aa  143  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
233 aa  142  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
233 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.929403  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>