52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3275 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3275  protein of unknown function DUF164  100 
 
 		 242 aa  463  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  47.7 
 
 		 245 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  46.86 
 
 		 245 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  49.38 
 
 		 246 aa  198  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  48.95 
 
 		 245 aa  194  9e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  46.06 
 
 		 247 aa  177  9e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  48.33 
 
 		 245 aa  176  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  47.72 
 
 		 246 aa  176  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  44.17 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5890  protein of unknown function DUF164  45.31 
 
 		 255 aa  170  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.498958 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  44.4 
 
 		 247 aa  169  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  44.35 
 
 		 245 aa  165  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  41.84 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  40.66 
 
 		 253 aa  155  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2711  protein of unknown function DUF164  40.17 
 
 		 246 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.176281  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  41.67 
 
 		 247 aa  152  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  41.38 
 
 		 237 aa  151  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1829  hypothetical protein  44.21 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.14591  normal  0.0297669 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  41.53 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  46.47 
 
 		 247 aa  145  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  40.91 
 
 		 245 aa  144  9e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  40.25 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  43.78 
 
 		 244 aa  138  8.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  39.22 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12258  hypothetical protein  43.8 
 
 		 245 aa  131  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.779709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  41.94 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3354  hypothetical protein  41.56 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3405  hypothetical protein  41.56 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3343  hypothetical protein  41.56 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  42.86 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  40.6 
 
 		 249 aa  121  8e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2443  hypothetical protein  34.82 
 
 		 245 aa  95.9  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0111287  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2192  protein of unknown function DUF164  34.01 
 
 		 245 aa  95.1  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158316 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1350  protein of unknown function DUF164  32.24 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000260914  normal  0.479391 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  29.55 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  24.3 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  34.35 
 
 		 245 aa  53.1  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  28.69 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  24.35 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  20.69 
 
 		 256 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  22.4 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3081  hypothetical protein  30.91 
 
 		 116 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  25.4 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  23.78 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_302  hypothetical protein  24.73 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0341  hypothetical protein  25 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0595  chromosome segregation ATPases-like  27.2 
 
 		 1675 aa  43.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.401487 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09480  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  33.2 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2458  hypothetical protein  18.72 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.223806  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  20.94 
 
 		 244 aa  42  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0383  large adhesin  27.08 
 
 		 4238 aa  41.6  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  31.78 
 
 		 239 aa  42  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>