More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0463 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0463  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
457 aa  924    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  47.24 
 
 
457 aa  428  1e-118  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0138  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.33 
 
 
491 aa  422  1e-117  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.85 
 
 
466 aa  419  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.39 
 
 
469 aa  415  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.850345  decreased coverage  0.00227015 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0992  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.78 
 
 
468 aa  417  9.999999999999999e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.19 
 
 
472 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.52 
 
 
473 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1811  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.67 
 
 
465 aa  411  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.22 
 
 
473 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.61 
 
 
477 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.22 
 
 
473 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.95 
 
 
465 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.57 
 
 
473 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0611  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.91 
 
 
463 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512717  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1720  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.72 
 
 
465 aa  400  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.160596  normal  0.364813 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.4 
 
 
480 aa  399  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.03 
 
 
464 aa  397  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.56 
 
 
480 aa  393  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1425  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.67 
 
 
466 aa  394  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197772  hitchhiker  0.000000283985 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2779  dihydrolipoamide dehydrogenase E3 component of 3 enzyme complexes  45.67 
 
 
463 aa  389  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.285583  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.4 
 
 
479 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.61 
 
 
479 aa  391  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.4 
 
 
479 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.39 
 
 
464 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.73 
 
 
464 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3894  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.42 
 
 
471 aa  388  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.287099 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.89 
 
 
479 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0279881  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.95 
 
 
465 aa  385  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.82 
 
 
465 aa  385  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2823  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.52 
 
 
465 aa  384  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.52 
 
 
468 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.95 
 
 
478 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2063  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.22 
 
 
487 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.05 
 
 
477 aa  379  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1626  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.05 
 
 
487 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5901  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.89 
 
 
478 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.38 
 
 
487 aa  370  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.63 
 
 
486 aa  365  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.206341  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1081  dihydrolipoamide dehydrogenase  44 
 
 
481 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378558  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.17 
 
 
539 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.89 
 
 
465 aa  363  3e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0853  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.27 
 
 
465 aa  363  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50611  normal  0.0780472 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.83 
 
 
470 aa  362  8e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.31 
 
 
481 aa  361  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.75 
 
 
481 aa  356  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.09 
 
 
482 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2755  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.85 
 
 
466 aa  349  5e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0982206  hitchhiker  0.000532855 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  43.38 
 
 
464 aa  347  2e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.36 
 
 
474 aa  345  7e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.3 
 
 
462 aa  341  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.9 
 
 
468 aa  339  7e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.87 
 
 
465 aa  338  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.43 
 
 
462 aa  338  9.999999999999999e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.29 
 
 
470 aa  334  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.82 
 
 
468 aa  333  3e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0784  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 
472 aa  333  5e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.95 
 
 
466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.99 
 
 
471 aa  324  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.7 
 
 
462 aa  319  7.999999999999999e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.54 
 
 
471 aa  318  9e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.09 
 
 
471 aa  317  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0435  hypothetical protein  41.21 
 
 
478 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0273668 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.66 
 
 
465 aa  313  3.9999999999999997e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.45 
 
 
473 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.47 
 
 
471 aa  313  5.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.36 
 
 
473 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1797  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.69 
 
 
474 aa  309  6.999999999999999e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.94 
 
 
465 aa  308  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.07 
 
 
473 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1689  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.22 
 
 
462 aa  306  5.0000000000000004e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.08159 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.07 
 
 
473 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.07 
 
 
473 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.07 
 
 
473 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.07 
 
 
473 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.07 
 
 
473 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.07 
 
 
473 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.85 
 
 
473 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.85 
 
 
473 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.85 
 
 
473 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.14 
 
 
473 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.46 
 
 
459 aa  299  5e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.17 
 
 
474 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.91 
 
 
468 aa  298  2e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.28 
 
 
469 aa  297  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.52 
 
 
464 aa  296  7e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.52 
 
 
464 aa  295  9e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.91 
 
 
465 aa  295  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822199  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.03 
 
 
459 aa  294  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.31 
 
 
476 aa  293  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.52 
 
 
476 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.52 
 
 
476 aa  293  5e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.31 
 
 
476 aa  293  6e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.31 
 
 
476 aa  293  6e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.11 
 
 
474 aa  293  6e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0329202  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.31 
 
 
476 aa  293  6e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.31 
 
 
476 aa  293  6e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1632  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.38 
 
 
483 aa  293  6e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.872525  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.31 
 
 
476 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.31 
 
 
476 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>