More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0238 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0238  polyprenyl synthetase family protein  100 
 
 		 321 aa  652    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0405378  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  41.81 
 
 		 340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  41.46 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  42.16 
 
 		 339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_002978  WD0799  octaprenyl-diphosphate synthase  40.43 
 
 		 328 aa  196  5.000000000000001e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.286745  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1115  Polyprenyl synthetase  38.57 
 
 		 337 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2950  farnesyltranstransferase  36.81 
 
 		 360 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530131  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  41.09 
 
 		 351 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0855  polyprenyl synthetase  41.18 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  40.43 
 
 		 335 aa  189  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  39.26 
 
 		 340 aa  189  7e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0053  trans-hexaprenyltrans transferase  39.93 
 
 		 325 aa  187  3e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  39.78 
 
 		 328 aa  186  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0088  octaprenyl-diphosphate synthase  37.54 
 
 		 325 aa  187  3e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.52685  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2749  polyprenyl synthetase  39.11 
 
 		 345 aa  186  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0535555  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  36.84 
 
 		 333 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  36.84 
 
 		 333 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  38.15 
 
 		 356 aa  185  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  36.48 
 
 		 358 aa  185  8e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4378  Polyprenyl synthetase  38.75 
 
 		 345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  36.51 
 
 		 333 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  34.15 
 
 		 331 aa  183  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  37.04 
 
 		 341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  39.54 
 
 		 338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  40 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  40.44 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  40 
 
 		 336 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  39.34 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  40 
 
 		 336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  37.63 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  40.07 
 
 		 336 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  34.87 
 
 		 335 aa  180  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  40.35 
 
 		 336 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  39.34 
 
 		 336 aa  179  8e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  38.85 
 
 		 338 aa  179  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  34.44 
 
 		 336 aa  176  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  37.46 
 
 		 322 aa  176  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0722  polyprenyl synthetase  37.62 
 
 		 339 aa  176  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  38.87 
 
 		 324 aa  174  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  35.03 
 
 		 337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  37.72 
 
 		 322 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  37.16 
 
 		 322 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  37.72 
 
 		 322 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  37.72 
 
 		 322 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  37.02 
 
 		 334 aa  172  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1998  polyprenyl synthetase  35.69 
 
 		 292 aa  172  9e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.553605 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  35.76 
 
 		 333 aa  172  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2996  octaprenyl-diphosphate synthase  38.52 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  46.83 
 
 		 322 aa  169  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  43.53 
 
 		 345 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0458  polyprenyl synthetase  37.78 
 
 		 338 aa  169  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.480075 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  37.58 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  35.21 
 
 		 332 aa  169  8e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  40.23 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0943  octaprenyl-diphosphate synthase  37.46 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.560813  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  38.95 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  38.78 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  40.23 
 
 		 322 aa  165  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  39.04 
 
 		 323 aa  165  8e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  36.49 
 
 		 322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  33.75 
 
 		 343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  37.59 
 
 		 332 aa  163  3e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  39.31 
 
 		 327 aa  164  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  33.23 
 
 		 324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  34.98 
 
 		 324 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  36.33 
 
 		 322 aa  161  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.84 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  37.23 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0890  polyprenyl synthetase  39.25 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0253423 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  36.75 
 
 		 324 aa  161  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  37.17 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0567  Farnesyltranstransferase  43.04 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  40.38 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  37.25 
 
 		 322 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  38.98 
 
 		 359 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0523  Polyprenyl synthetase  43.61 
 
 		 338 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.057969  normal  0.393199 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  37.25 
 
 		 322 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  33.57 
 
 		 317 aa  159  8e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  34.17 
 
 		 324 aa  158  9e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2184  trans-hexaprenyltranstransferase  33.86 
 
 		 340 aa  158  9e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  41.51 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  40.89 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  42.86 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  39.43 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  33.64 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  42.72 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  39 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0657  polyprenyl synthetase  33.12 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  38.46 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  42.36 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  37.28 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0742  trans-hexaprenyltranstransferase  33.12 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.247757  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  35.69 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3230  polyprenyl synthetase  32.79 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00305524  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  41.04 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  39.92 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  35.92 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  36.54 
 
 		 324 aa  155  6e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  41.87 
 
 		 323 aa  156  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>