75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0132 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0132  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 
174 aa  351  2e-96  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0131  ATP synthase F1, delta subunit  27.01 
 
 
185 aa  60.5  0.00000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0082  H+-transporting two-sector ATPase, delta(OSCP) subunit  25 
 
 
183 aa  58.2  0.00000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.41 
 
 
193 aa  54.3  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.14 
 
 
180 aa  53.9  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
186 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.82 
 
 
186 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.32 
 
 
186 aa  52.4  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.6 
 
 
183 aa  52.4  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.17 
 
 
186 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.49 
 
 
186 aa  51.6  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.49 
 
 
186 aa  51.6  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.59 
 
 
186 aa  51.2  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.48 
 
 
186 aa  51.2  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  26.95 
 
 
186 aa  50.8  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.07 
 
 
186 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
186 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  26.32 
 
 
194 aa  49.3  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44603  predicted protein  31.96 
 
 
220 aa  48.9  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.9 
 
 
188 aa  47.8  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  26.95 
 
 
217 aa  47.8  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.9 
 
 
188 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4048  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.29 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572688  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0305  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.84 
 
 
180 aa  45.1  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790297 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0300  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.84 
 
 
180 aa  45.1  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10000  ATP synthase, F1 delta subunit  31.31 
 
 
271 aa  44.7  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179635  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.51 
 
 
186 aa  45.1  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1872  F0F1-type ATP synthase, delta subunit  26.55 
 
 
180 aa  44.7  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0656  ATP synthase F1, delta subunit  23.63 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0940126  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06287  ATP synthase oligomycin sensitivity conferral protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12400)  30.69 
 
 
227 aa  44.3  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.822341  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3815  ATP synthase F1, delta subunit  29.38 
 
 
211 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_500  ATP synthase F1, delta subunit  29.45 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0258764  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0561  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.45 
 
 
180 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.132233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.42 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0477  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.27 
 
 
183 aa  43.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199048  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.59 
 
 
184 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  23.98 
 
 
190 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 
275 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  23.64 
 
 
179 aa  42.4  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0369  F0F1 ATP synthase subunit delta  20.93 
 
 
180 aa  42.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.398312 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.82 
 
 
182 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4223  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.22 
 
 
177 aa  42  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000462366  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4205  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.22 
 
 
177 aa  42  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000051054  normal  0.165641 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.14 
 
 
190 aa  42  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0005  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.78 
 
 
177 aa  42  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000453389  hitchhiker  0.00865282 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  26.35 
 
 
201 aa  42  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3969  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.16 
 
 
178 aa  42.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110961  normal  0.295514 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4179  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.22 
 
 
177 aa  42  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  24.55 
 
 
189 aa  42  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  23.03 
 
 
184 aa  42  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6359  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.15 
 
 
178 aa  41.6  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.24 
 
 
182 aa  41.6  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4544  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.36 
 
 
177 aa  41.6  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0114562  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4254  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.3 
 
 
177 aa  41.6  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.177027  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2872  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.04 
 
 
179 aa  41.6  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73280  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.15 
 
 
178 aa  41.6  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3358  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.36 
 
 
179 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1267  ATP synthase F1, delta subunit  25.24 
 
 
276 aa  41.2  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2525  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.04 
 
 
177 aa  41.2  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.046669  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.47 
 
 
178 aa  41.2  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  25 
 
 
186 aa  41.2  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  25 
 
 
186 aa  41.2  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  26.86 
 
 
190 aa  41.2  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0144  ATP synthase F1, delta subunit  26.26 
 
 
177 aa  40.8  0.009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  decreased coverage  0.000353318  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2954  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.36 
 
 
179 aa  40.8  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0301983  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  29.7 
 
 
275 aa  40.8  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3012  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.36 
 
 
179 aa  40.8  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3311  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.36 
 
 
179 aa  40.8  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0205663  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.84 
 
 
178 aa  40.8  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4045  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.36 
 
 
179 aa  40.8  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  26.04 
 
 
189 aa  40.8  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3971  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.36 
 
 
179 aa  40.8  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1590  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.36 
 
 
179 aa  40.8  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0134138  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.26 
 
 
180 aa  40.8  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.12 
 
 
180 aa  40.8  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>