39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1095 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1095  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 
123 aa  252  1.0000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1186  molydopterin dinucleotide-binding region  42.02 
 
 
129 aa  99.4  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0619924  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0344  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  42.4 
 
 
128 aa  95.9  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0493  molydopterin dinucleotide-binding region  42.4 
 
 
128 aa  94  7e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1426  molydopterin dinucleotide-binding region  42.4 
 
 
128 aa  92.8  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  38.33 
 
 
574 aa  87  8e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0561  molydopterin dinucleotide-binding region  38.4 
 
 
128 aa  86.7  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2107  molydopterin dinucleotide-binding region  39.5 
 
 
129 aa  86.3  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1984  molydopterin dinucleotide-binding region  38.98 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0621  molydopterin dinucleotide-binding region  38.89 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270676  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0243  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  37.19 
 
 
131 aa  77.4  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.208129  normal  0.212279 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  31.97 
 
 
425 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2237  molydopterin dinucleotide-binding region  37.5 
 
 
134 aa  73.6  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.255256  normal  0.0380736 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1463  molydopterin dinucleotide-binding region  31.9 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2236  molydopterin dinucleotide-binding region  36.67 
 
 
134 aa  72  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.0387564 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0101  molydopterin dinucleotide-binding region  31.9 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.526644  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1829  molydopterin dinucleotide-binding region  40.37 
 
 
587 aa  68.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0976  molydopterin dinucleotide-binding region  27.5 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1291  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  29.27 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0878  molydopterin dinucleotide-binding region  33.9 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1470  molydopterin dinucleotide-binding region  29.17 
 
 
136 aa  60.8  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0373  molydopterin dinucleotide-binding region  34.95 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.827239  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1993  molydopterin dinucleotide-binding region  31.93 
 
 
134 aa  57.4  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0699041  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0204  molydopterin dinucleotide-binding region  31.82 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0715847 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2923  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  30.4 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0830145  hitchhiker  0.000724487 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  29.31 
 
 
415 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1987  molydopterin dinucleotide-binding region  29.75 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.295284  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  27.59 
 
 
415 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  27.59 
 
 
415 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  26.32 
 
 
424 aa  48.1  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1950  molybdopterin oxidoreductase  42.86 
 
 
858 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1956  molybdopterin oxidoreductase  42.86 
 
 
857 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0282  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  25.2 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2346  molybdopterin oxidoreductase  35.48 
 
 
879 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.951225  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  34.18 
 
 
1412 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0337  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  25.89 
 
 
132 aa  42  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2107  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  27.08 
 
 
883 aa  41.6  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000158508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2333  molybdopterin oxidoreductase  28.71 
 
 
880 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3905  molybdopterin oxidoreductase  33.77 
 
 
859 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>