More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2912 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2912  trigger factor  100 
 
 		 462 aa  915    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2185  trigger factor  67.34 
 
 		 460 aa  598  1e-170  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.368629  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5133  trigger factor  59.42 
 
 		 473 aa  544  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.69039 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2370  trigger factor  57.79 
 
 		 478 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2415  trigger factor  58.54 
 
 		 478 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.502295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2678  trigger factor  58.54 
 
 		 478 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111476  normal  0.981646 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7404  trigger factor  57.73 
 
 		 473 aa  536  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6582  trigger factor  59.46 
 
 		 485 aa  531  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0465754 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3590  trigger factor  53.08 
 
 		 452 aa  504  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0497135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1181  trigger factor  52.77 
 
 		 491 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.176713  normal  0.0554389 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3310  trigger factor  50.88 
 
 		 452 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  51.46 
 
 		 512 aa  464  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0553  trigger factor  49.34 
 
 		 474 aa  462  1e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017975  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2391  trigger factor  49.55 
 
 		 453 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1790  trigger factor  50.22 
 
 		 476 aa  458  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147522  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1703  trigger factor  49.32 
 
 		 494 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2562  trigger factor  49.67 
 
 		 452 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0895  trigger factor  51.22 
 
 		 485 aa  457  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0898  trigger factor  51.22 
 
 		 485 aa  455  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2280  trigger factor  50.78 
 
 		 485 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2895  trigger factor  49.34 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.590231  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4575  trigger factor  48.78 
 
 		 452 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.136212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1900  trigger factor  48.44 
 
 		 453 aa  449  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.958008 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2478  trigger factor  49.67 
 
 		 493 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.656979  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1505  trigger factor  49.77 
 
 		 495 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2230  trigger factor  45.59 
 
 		 453 aa  428  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  48.22 
 
 		 463 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1337  trigger factor  46.67 
 
 		 518 aa  410  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.270787  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  48.43 
 
 		 440 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2849  trigger factor  45.54 
 
 		 454 aa  388  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0303006 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  43.15 
 
 		 513 aa  362  1e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0594  trigger factor  41.94 
 
 		 551 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1033  trigger factor  43.74 
 
 		 443 aa  347  3e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0887  trigger factor  45.95 
 
 		 459 aa  345  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109425  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3323  trigger factor  44.87 
 
 		 445 aa  342  7e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.113258 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2190  trigger factor  41.78 
 
 		 442 aa  332  7.000000000000001e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1613  trigger factor  41.76 
 
 		 441 aa  330  2e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1349  trigger factor  43.43 
 
 		 444 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295342  normal  0.310757 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0843  trigger factor  39.78 
 
 		 544 aa  324  3e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.0950155 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0142  trigger factor  42.76 
 
 		 444 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1775  trigger factor  42.76 
 
 		 444 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  34.14 
 
 		 435 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  33.71 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  34.46 
 
 		 436 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  34.75 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  33.79 
 
 		 441 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  31.93 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  34.9 
 
 		 434 aa  241  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  32.14 
 
 		 447 aa  241  2e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  33.92 
 
 		 436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1905  trigger factor  35.6 
 
 		 448 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  34.01 
 
 		 436 aa  239  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1553  trigger factor  34.74 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2296  trigger factor  35.38 
 
 		 448 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  31.47 
 
 		 447 aa  238  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2510  trigger factor  34.45 
 
 		 437 aa  237  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  33.11 
 
 		 436 aa  237  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  34.55 
 
 		 448 aa  238  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1010  trigger factor  35.38 
 
 		 448 aa  236  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595556  normal  0.725112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3470  trigger factor  34.01 
 
 		 437 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745697 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  34.08 
 
 		 435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  34.15 
 
 		 434 aa  235  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1947  trigger factor  34.95 
 
 		 448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1842  trigger factor  34.72 
 
 		 448 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0231887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  33.78 
 
 		 443 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  33.33 
 
 		 436 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1912  trigger factor  34.72 
 
 		 448 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  34.25 
 
 		 437 aa  233  5e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5225  trigger factor  34.51 
 
 		 448 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1208  trigger factor  34.68 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.774051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1127  trigger factor  34.68 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6155  trigger factor  34.51 
 
 		 448 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1924  trigger factor  34.51 
 
 		 448 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.317146  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2545  trigger factor  34.3 
 
 		 435 aa  231  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0171608 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  34.02 
 
 		 437 aa  230  4e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  33.56 
 
 		 437 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  33.78 
 
 		 434 aa  230  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1348  trigger factor  34.73 
 
 		 448 aa  229  6e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514517  normal  0.0597463 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  32.97 
 
 		 450 aa  229  6e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3347  trigger factor  35.16 
 
 		 449 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.012061  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1233  trigger factor  35.16 
 
 		 449 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.026693  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1466  trigger factor  35.16 
 
 		 449 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118979  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  33.11 
 
 		 437 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1958  trigger factor  35.16 
 
 		 449 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2366  trigger factor  35.16 
 
 		 449 aa  229  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3497  trigger factor  33.56 
 
 		 436 aa  229  9e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0314111  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2482  trigger factor  34.95 
 
 		 449 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1291  trigger factor  34.08 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0308812 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2324  trigger factor  34.95 
 
 		 449 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0174102  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  32.88 
 
 		 436 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  33.33 
 
 		 434 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41250  trigger factor  33.33 
 
 		 436 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.755772 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2644  trigger factor  34.3 
 
 		 436 aa  225  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156375 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23550  trigger factor  34.16 
 
 		 436 aa  225  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2029  trigger factor  33.18 
 
 		 436 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184706  normal  0.0504057 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2118  trigger factor  34.07 
 
 		 449 aa  223  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1460  trigger factor  33.41 
 
 		 436 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.944672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  32.66 
 
 		 432 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  32.66 
 
 		 432 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  32.66 
 
 		 432 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>