116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1200 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 150 aa  294  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  37.29 
 
 		 227 aa  95.5  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  44.44 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  44.44 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  38.17 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  40.5 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  40 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  40.34 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5080  ribonuclease P protein component  41.61 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.479331 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  51.16 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  39.67 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  42.45 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  36.8 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  39.62 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  39.66 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  39.02 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5376  ribonuclease P protein  38.41 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827192  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  38.79 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0068  ribonuclease P protein component  44.35 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190277  decreased coverage  0.00398675 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  38.1 
 
 		 240 aa  64.7  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  42.86 
 
 		 189 aa  63.5  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0684  ribonuclease P protein component  44.35 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.820887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7325  ribonuclease P protein component  40.31 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1362  ribonuclease P  40.91 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  32.03 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0375  ribonuclease P  43.4 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.174091  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0641  ribonuclease P protein component  36.89 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244598  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3075  ribonuclease P protein  42.59 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0584  hypothetical protein  32.38 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000877288  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3704  ribonuclease P protein component  42.59 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0637  ribonuclease P protein component  40.35 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150092  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  38.95 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0356  ribonuclease P protein component  43.93 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274871  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  36.89 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  38.95 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  38.6 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3504  ribonuclease P protein component  45.05 
 
 		 206 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3337  ribonuclease P protein  41.88 
 
 		 174 aa  51.2  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1922  ribonuclease P protein component  39.86 
 
 		 187 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.239501  normal  0.549748 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  35.29 
 
 		 116 aa  51.2  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0300  ribonuclease P protein component  43.82 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  40.85 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  36.05 
 
 		 121 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  35.29 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  32.54 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  33.88 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  25.69 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  28.57 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2631  ribonuclease P protein component  41.96 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88975  normal  0.0705179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2352  ribonuclease P protein component  41.96 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.125747 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  44.12 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  44.12 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  29.91 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2309  ribonuclease P protein component  38.39 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  0.100774 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  45.31 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  33.03 
 
 		 123 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  30.59 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0439  hypothetical protein  31 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00442765  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  37.04 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0818  ribonuclease P protein component  43.02 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  37.76 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  32.98 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  31.75 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  37.68 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  36.44 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  34.72 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  34.92 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  30.53 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  32.67 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  32.56 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  32.56 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  45.76 
 
 		 126 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  30.53 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1040  ribonuclease P protein component  33.67 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0513155  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  32.14 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  56.76 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  33.98 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  63.33 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  42.11 
 
 		 180 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  40.79 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1256  ribonuclease P protein component  37.68 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000286956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  35.21 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  28.3 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  28.97 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  28.3 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  28.3 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  28.3 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  28.3 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  34.31 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  35.29 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  35.29 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  44.07 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  27.52 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0821  ribonuclease P protein component  32.65 
 
 		 108 aa  42.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  28.3 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  28.3 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0983  ribonuclease P protein component  31.63 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.162194  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  34.38 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  29.25 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>