154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0588 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0588  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  100 
 
 		 208 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2704  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  62.38 
 
 		 146 aa  135  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2486  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  52.63 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713798  normal  0.019801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  54.08 
 
 		 169 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2184  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.51 
 
 		 157 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427852  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2763  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40 
 
 		 198 aa  101  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02538  normal  0.128057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3591  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.52 
 
 		 159 aa  99  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.733353 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3400  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48 
 
 		 153 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3709  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48 
 
 		 153 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  48.94 
 
 		 180 aa  95.9  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  47.47 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  60.87 
 
 		 178 aa  92.8  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  47.57 
 
 		 180 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  47.42 
 
 		 172 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  46.39 
 
 		 200 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3188  putative sec-independent protein translocase protein  47.25 
 
 		 169 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1772  twin-arginine translocation protein TatB  44.05 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.76 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350642  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0439  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.04 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0551214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1796  twin-arginine translocation protein TatB  39.58 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2344  sec-independent translocase  38.98 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.160034  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  50.82 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_004310  BR0883  sec-independent translocase  43 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0874  sec-independent translocase  43 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.817267  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1805  sec-independent translocase  43.82 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365946  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0955  hypothetical protein  44.3 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45.59 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1488  sec-independent translocase  34.56 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1165  sec-independent translocase  38.3 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151215  normal  0.188357 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.18 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  36.05 
 
 		 103 aa  57.4  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0908  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.93 
 
 		 167 aa  57.8  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.305104  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.18 
 
 		 122 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3028  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.84 
 
 		 159 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.300806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  33.65 
 
 		 162 aa  57  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1686  sec-independent translocase  37.76 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1807  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.94 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.988739  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  26.36 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2667  SEC-independent protein translocase protein  40.26 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  35.14 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  33.91 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  36.67 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  32 
 
 		 120 aa  53.9  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1181  sec-independent translocase  36.49 
 
 		 152 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.49 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.76 
 
 		 254 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  44.68 
 
 		 126 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.34 
 
 		 128 aa  53.1  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1210  twin-arginine translocation protein TatB  52.27 
 
 		 173 aa  52.8  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  42.31 
 
 		 104 aa  52.8  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  29.25 
 
 		 125 aa  52  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  39.66 
 
 		 111 aa  51.6  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  32.53 
 
 		 118 aa  51.6  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0700  sec-independent translocase  35.71 
 
 		 154 aa  51.6  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5555  sec-independent translocase  38.81 
 
 		 165 aa  51.6  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  41.82 
 
 		 149 aa  50.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.81 
 
 		 113 aa  50.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  29.63 
 
 		 88 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  25.26 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  24.21 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  24.21 
 
 		 171 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  24.21 
 
 		 171 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  24.21 
 
 		 171 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  30.09 
 
 		 139 aa  49.7  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  24.21 
 
 		 171 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2609  hypothetical protein  35 
 
 		 142 aa  49.7  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.63 
 
 		 152 aa  49.7  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.47 
 
 		 151 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  24.21 
 
 		 171 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  24.21 
 
 		 171 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  24.21 
 
 		 171 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  24.21 
 
 		 171 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  26.32 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  29.23 
 
 		 172 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0745  sec-independent translocase  30.77 
 
 		 159 aa  49.3  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0849771  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0842  sec-independent translocase  32.43 
 
 		 170 aa  49.3  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  26.15 
 
 		 132 aa  49.3  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2747  sec-independent translocase  28.7 
 
 		 182 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40 
 
 		 140 aa  48.9  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1054  sec-independent translocase  36.62 
 
 		 164 aa  49.3  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0815  sec-independent translocase  35.14 
 
 		 160 aa  48.9  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0782  sec-independent translocase  30.11 
 
 		 159 aa  48.9  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0330994 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 		 88 aa  48.5  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2981  sec-independent translocase  27.27 
 
 		 175 aa  48.5  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0753  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.43 
 
 		 156 aa  48.5  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3681  sec-independent translocase  27.55 
 
 		 175 aa  48.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655432  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3654  sec-independent translocase  27.55 
 
 		 175 aa  48.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3712  sec-independent translocase  27.55 
 
 		 175 aa  48.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  24.21 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2702  sec-independent translocase  27.55 
 
 		 175 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  24.21 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  24.21 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  27.66 
 
 		 175 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  24.21 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3251  sec-independent translocase  27.55 
 
 		 175 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  24.21 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1800  sec-independent translocase  27.55 
 
 		 175 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2753  sec-independent translocase  27.55 
 
 		 175 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  25.26 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>