More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0556 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0556  cytochrome P450 enzyme  100 
 
 
407 aa  813    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0542  cytochrome P450  100 
 
 
413 aa  813    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.353046 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  35.54 
 
 
402 aa  238  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  35.71 
 
 
401 aa  237  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  34.99 
 
 
405 aa  230  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  36.5 
 
 
398 aa  220  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  34.4 
 
 
407 aa  212  9e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  36.27 
 
 
426 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  36 
 
 
399 aa  209  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  33.33 
 
 
408 aa  205  9e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  35.27 
 
 
402 aa  203  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  30.37 
 
 
410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  29.46 
 
 
411 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  28.89 
 
 
411 aa  199  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  34 
 
 
412 aa  199  7e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  29.21 
 
 
411 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  29.21 
 
 
411 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  29.95 
 
 
411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  31.72 
 
 
411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  29.21 
 
 
411 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  29.21 
 
 
411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  28.96 
 
 
411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  34.33 
 
 
436 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  32.09 
 
 
412 aa  197  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  33.66 
 
 
410 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  28.39 
 
 
411 aa  196  9e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  29.53 
 
 
411 aa  196  9e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  28.39 
 
 
411 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  35.75 
 
 
412 aa  193  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  35.7 
 
 
400 aa  193  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  32.18 
 
 
405 aa  192  9e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  33.87 
 
 
410 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2032  cytochrome P450  33.58 
 
 
401 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0674155  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  32.09 
 
 
422 aa  189  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1581  cytochrome P450  32.51 
 
 
413 aa  189  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.845743  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  33.59 
 
 
402 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  35.59 
 
 
414 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4449  cytochrome P450  31.32 
 
 
398 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  32.69 
 
 
414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  29.85 
 
 
412 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3576  cytochrome P450  33.42 
 
 
439 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  30.94 
 
 
412 aa  182  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  32.51 
 
 
417 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  25.55 
 
 
420 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  32.88 
 
 
392 aa  180  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  30.2 
 
 
411 aa  178  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  33.33 
 
 
411 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  30.94 
 
 
413 aa  176  7e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  34.49 
 
 
408 aa  176  8e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  33.09 
 
 
416 aa  176  9e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  29.9 
 
 
419 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0677  cytochrome P450  32.51 
 
 
402 aa  173  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113337  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0160  cytochrome P450  30.32 
 
 
413 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2451  cytochrome P450  30.55 
 
 
414 aa  173  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  29.83 
 
 
407 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  33.33 
 
 
429 aa  173  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  32.12 
 
 
417 aa  173  5.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  30 
 
 
380 aa  172  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1827  cytochrome P450  32.75 
 
 
417 aa  171  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0199087 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  31.96 
 
 
417 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  30.83 
 
 
409 aa  170  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2132  cytochrome P450  32.97 
 
 
417 aa  170  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257002  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  30.6 
 
 
405 aa  170  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  32.17 
 
 
423 aa  169  7e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  30.94 
 
 
417 aa  169  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  31.57 
 
 
400 aa  168  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  32.6 
 
 
410 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  30.42 
 
 
402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  34.45 
 
 
418 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2764  cytochrome P450  32.45 
 
 
799 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1904  cytochrome P450  31.88 
 
 
443 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0944  cytochrome P450  31.62 
 
 
396 aa  166  9e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.46154 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  30.17 
 
 
402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1945  putative cytochrome P450  31.23 
 
 
442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  32.83 
 
 
408 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  32.86 
 
 
421 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  30.31 
 
 
423 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  29.53 
 
 
417 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  30.15 
 
 
400 aa  164  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  26.21 
 
 
403 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1797  cytochrome P450  31.08 
 
 
399 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  31.09 
 
 
411 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  28.54 
 
 
398 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32630  cytochrome P450  32.27 
 
 
444 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.301042  hitchhiker  0.00539785 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  34.16 
 
 
404 aa  162  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  33.43 
 
 
394 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  31.5 
 
 
417 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  31.39 
 
 
402 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  30.86 
 
 
398 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  32.31 
 
 
420 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  30.71 
 
 
408 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  31.11 
 
 
417 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  31.31 
 
 
408 aa  159  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  34.78 
 
 
406 aa  159  7e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0869  cytochrome P450  28.54 
 
 
415 aa  159  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  28.8 
 
 
406 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  33.77 
 
 
404 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1769  cytochrome P450  30.2 
 
 
395 aa  157  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.266129 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  30.47 
 
 
405 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  30.73 
 
 
407 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>