90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6372 on replicon NC_010514
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010514  Mrad2831_6372  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
268 aa  548  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1988  Phosphoglycerate mutase  38.96 
 
 
249 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2199  Phosphoglycerate mutase  36.29 
 
 
249 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0611897 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6517  predicted protein  33.33 
 
 
202 aa  102  9e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.454064  normal  0.773681 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04983  phosphoglycerate mutase family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10050)  30.94 
 
 
651 aa  90.9  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1314  phosphoglycerate mutase  28.16 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45200  predicted protein  27.87 
 
 
547 aa  80.9  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0608  Phosphoglycerate mutase  29.96 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85057  predicted protein  28.3 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0743  phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 
252 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702644  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02083  phosphoglycerate mutase family protein, putative  28.5 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.956321  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  29.07 
 
 
412 aa  61.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3699  Phosphoglycerate mutase  29.33 
 
 
253 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155498  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  26.87 
 
 
201 aa  55.8  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  26.87 
 
 
201 aa  55.8  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  25 
 
 
204 aa  55.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.03 
 
 
443 aa  52.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  26.64 
 
 
195 aa  52.8  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  25.99 
 
 
449 aa  52.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0181  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.41 
 
 
266 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  23.74 
 
 
442 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.58 
 
 
442 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0325  phosphoglycerate mutase family protein  24.69 
 
 
281 aa  50.1  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0120  phosphoglycerate mutase  25.71 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.59 
 
 
442 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  25.82 
 
 
207 aa  50.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 
214 aa  50.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0736  phosphoglycerate mutase (GpmB protein)-like  25.87 
 
 
208 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  26.36 
 
 
228 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0651  phosphoglycerate mutase family protein  28.14 
 
 
276 aa  47.8  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  31.76 
 
 
389 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  24.66 
 
 
215 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1393  Phosphoglycerate mutase  32.7 
 
 
197 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960696  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  24.66 
 
 
215 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  24.66 
 
 
215 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  24.66 
 
 
215 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  28.23 
 
 
209 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  24.66 
 
 
215 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  23.42 
 
 
442 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  29.95 
 
 
224 aa  47.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  26.03 
 
 
196 aa  47  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 
459 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  23.89 
 
 
444 aa  46.6  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3036  Phosphoglycerate mutase  27.88 
 
 
258 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.943102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  25.77 
 
 
203 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  30.52 
 
 
227 aa  46.2  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  25.56 
 
 
215 aa  46.2  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  25.56 
 
 
215 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  25.42 
 
 
214 aa  46.2  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  31.01 
 
 
234 aa  46.2  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  25.56 
 
 
215 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  26.85 
 
 
200 aa  45.8  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  25.56 
 
 
215 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  25.56 
 
 
215 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  25.56 
 
 
215 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  25.56 
 
 
215 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  25.56 
 
 
215 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  25.56 
 
 
215 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  29.14 
 
 
232 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  22.07 
 
 
208 aa  45.8  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  25.76 
 
 
241 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  25.85 
 
 
205 aa  45.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  28.87 
 
 
227 aa  45.4  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  24.09 
 
 
442 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  26.18 
 
 
213 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.24 
 
 
442 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  24.66 
 
 
442 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  26.73 
 
 
200 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  26.73 
 
 
200 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  23.63 
 
 
209 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  26.24 
 
 
193 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  27.04 
 
 
215 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  25 
 
 
200 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  27.04 
 
 
215 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  24.62 
 
 
233 aa  43.5  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  28.12 
 
 
240 aa  43.9  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  28.83 
 
 
223 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  29.52 
 
 
204 aa  43.9  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  26.05 
 
 
212 aa  43.5  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  26.34 
 
 
226 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  22.96 
 
 
213 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 
224 aa  43.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17495  bifunctional 6-phosphofructo-2-kinase  25.96 
 
 
540 aa  42.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1834  Phosphoglycerate mutase  29.02 
 
 
221 aa  42.7  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  24.45 
 
 
447 aa  42.7  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  23 
 
 
214 aa  42.4  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  25.45 
 
 
202 aa  42.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  27.17 
 
 
452 aa  42  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10190  fructose-2,6-bisphosphatase  22.71 
 
 
221 aa  42.4  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.149459  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  25.91 
 
 
448 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>