More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4538 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4538  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1090 aa  2201    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5876  acriflavin resistance protein  45.04 
 
 		 1082 aa  911    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0898662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5740  acriflavin resistance protein  45.85 
 
 		 1076 aa  917    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2952  acriflavin resistance protein  41.85 
 
 		 1057 aa  805    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477034  normal  0.0644125 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0178  AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.51 
 
 		 1056 aa  793    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4650  acriflavin resistance protein  44.58 
 
 		 1064 aa  845    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.763131  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02154  transport transmembrane protein  44.89 
 
 		 1064 aa  889    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1954  acriflavin resistance protein  43.55 
 
 		 1064 aa  859    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0077  hypothetical protein  43.46 
 
 		 1058 aa  870    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1816  acriflavin resistance protein  46.36 
 
 		 1072 aa  885    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0132878  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3856  acriflavin resistance protein  79.37 
 
 		 1076 aa  1720    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.112482 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0226  acriflavin resistance protein  66.76 
 
 		 1087 aa  1438    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.959643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0568  acriflavin resistance protein  42.31 
 
 		 1065 aa  787    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5687  acriflavin resistance protein  43.51 
 
 		 1084 aa  879    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117283 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1277  acriflavin resistance protein  36.07 
 
 		 1109 aa  639    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1726  acriflavin resistance protein  46.17 
 
 		 1055 aa  929    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0296271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4315  acriflavin resistance protein  79.32 
 
 		 1080 aa  1725    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.676925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4312  acriflavin resistance protein  46.3 
 
 		 1055 aa  918    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0578922  normal  0.332205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5200  acriflavin resistance protein  49.03 
 
 		 1052 aa  968    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1966  acriflavin resistance protein  44.67 
 
 		 1072 aa  855    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.882579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3609  acriflavin resistance protein  42.79 
 
 		 1064 aa  851    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.810117  normal  0.320832 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2848  acriflavin resistance protein  43.26 
 
 		 1057 aa  858    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0271667 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4615  acriflavin resistance protein  42.16 
 
 		 1061 aa  812    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7212  acriflavin resistance protein  45.22 
 
 		 1065 aa  893    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.407199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3360  cation efflux transporter  42.79 
 
 		 1061 aa  874    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4362  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  45.01 
 
 		 1060 aa  902    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.555572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1393  cation efflux transporter  45.91 
 
 		 1081 aa  905    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.264044  normal  0.0907151 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2878  acriflavin resistance protein  68.92 
 
 		 1070 aa  1538    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.304321 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2072  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  45.13 
 
 		 1082 aa  914    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.739082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1140  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  42.52 
 
 		 1063 aa  871    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.359537 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6522  acriflavin resistance protein  44.84 
 
 		 1078 aa  900    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658721  normal  0.0251174 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1750  acriflavin resistance protein  44.34 
 
 		 1065 aa  876    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3819  acriflavin resistance protein  46.67 
 
 		 1068 aa  916    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2553  acriflavin resistance protein  47.37 
 
 		 1072 aa  953    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.234071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1501  acriflavin resistance protein  45.63 
 
 		 1082 aa  878    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157071  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3751  acriflavin resistance protein  43.51 
 
 		 1084 aa  879    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4073  acriflavin resistance protein  45.92 
 
 		 1055 aa  929    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435843  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6992  acriflavin resistance protein  45.45 
 
 		 1082 aa  889    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166415 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3224  acriflavin resistance protein  46.02 
 
 		 1055 aa  931    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292287 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1437  acriflavin resistance protein  44.58 
 
 		 1064 aa  845    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.409748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2444  acriflavin resistance protein  54.21 
 
 		 1073 aa  1111    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.011733 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4896  acriflavin resistance protein  46.67 
 
 		 1068 aa  916    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.428837 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0360  acriflavin resistance protein  45.01 
 
 		 1060 aa  901    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2096  acriflavin resistance protein  44.64 
 
 		 1072 aa  851    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3711  acriflavin resistance protein  46.77 
 
 		 1055 aa  928    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5984  acriflavin resistance protein  45.76 
 
 		 1076 aa  916    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.026118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4165  acriflavin resistance protein  79.28 
 
 		 1076 aa  1718    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.352988 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4293  acriflavin resistance protein  45.92 
 
 		 1055 aa  929    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4617  acriflavin resistance protein  43.51 
 
 		 1084 aa  879    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406351  normal  0.0806311 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6328  acriflavin resistance protein  45.63 
 
 		 1082 aa  878    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0756078  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2716  acriflavin resistance protein  38.24 
 
 		 1057 aa  721    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.222625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4189  acriflavin resistance protein  46.58 
 
 		 1055 aa  922    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5202  acriflavin resistance protein  45.93 
 
 		 1084 aa  903    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.842628  normal  0.949774 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.4 
 
 		 1462 aa  803    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1699  acriflavin resistance protein  32.84 
 
 		 1044 aa  588  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920783  normal  0.0913661 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0461  acriflavin resistance protein  33.21 
 
 		 1075 aa  553  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4285  acriflavin resistance protein  31.86 
 
 		 1095 aa  546  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1722  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.75 
 
 		 1049 aa  543  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1160  acriflavin resistance protein  32.76 
 
 		 1086 aa  538  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.561236 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0256  acriflavin resistance protein  31 
 
 		 1104 aa  528  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543076  normal  0.0161956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.5 
 
 		 1460 aa  522  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4013  acriflavin resistance protein  31.39 
 
 		 1052 aa  501  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00812103  normal  0.0431694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2616  acriflavin resistance protein  30.93 
 
 		 1087 aa  490  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0710341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2583  acriflavin resistance protein  30.15 
 
 		 1072 aa  488  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000643867  normal  0.0481028 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  29.29 
 
 		 1043 aa  398  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0122  acriflavin resistance protein  43.48 
 
 		 1122 aa  392  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.266494 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  27.42 
 
 		 1034 aa  368  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  26.05 
 
 		 1032 aa  358  3.9999999999999996e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  27.33 
 
 		 1069 aa  346  1e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  26.03 
 
 		 1046 aa  345  2e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.13 
 
 		 1024 aa  340  8e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  28.05 
 
 		 1050 aa  339  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  26.91 
 
 		 1041 aa  338  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  28.49 
 
 		 1055 aa  337  5.999999999999999e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  29.5 
 
 		 1054 aa  335  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  27.69 
 
 		 1034 aa  335  3e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  29.41 
 
 		 1054 aa  335  4e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  26.78 
 
 		 1496 aa  334  6e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  26.73 
 
 		 1071 aa  333  8e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  29.5 
 
 		 1054 aa  332  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  25.38 
 
 		 1044 aa  331  4e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  26.77 
 
 		 1036 aa  331  5.0000000000000004e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  26.97 
 
 		 1039 aa  328  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  26.2 
 
 		 1053 aa  329  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.25 
 
 		 1049 aa  327  6e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  26.12 
 
 		 1051 aa  327  7e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  27.98 
 
 		 1049 aa  326  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  26.11 
 
 		 1095 aa  327  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  28.11 
 
 		 1067 aa  324  6e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  27.02 
 
 		 1063 aa  320  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  26.43 
 
 		 1058 aa  319  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.61 
 
 		 1024 aa  319  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  25.77 
 
 		 1011 aa  319  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  25.44 
 
 		 1048 aa  318  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  27.09 
 
 		 1173 aa  316  9.999999999999999e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  26.41 
 
 		 1039 aa  316  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  25.53 
 
 		 1038 aa  316  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  26.25 
 
 		 1044 aa  313  9e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  27.33 
 
 		 1036 aa  312  2e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  26.67 
 
 		 1048 aa  312  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>