More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0488 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0488  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 140 aa  284  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.94112  normal  0.716052 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2288  nucleoside diphosphate kinase  92.14 
 
 		 140 aa  266  5e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1974  nucleoside diphosphate kinase  91.43 
 
 		 140 aa  265  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.209722 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2012  nucleoside diphosphate kinase  91.43 
 
 		 140 aa  265  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.684832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4923  nucleoside diphosphate kinase  86.96 
 
 		 140 aa  249  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0403558  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4361  nucleoside diphosphate kinase  84.78 
 
 		 140 aa  245  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2328  nucleoside diphosphate kinase  78.99 
 
 		 140 aa  225  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3466  nucleoside diphosphate kinase  76.09 
 
 		 140 aa  226  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157142  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2538  nucleoside diphosphate kinase  78.68 
 
 		 139 aa  224  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.565005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2318  nucleoside diphosphate kinase  74.64 
 
 		 140 aa  221  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2122  nucleoside diphosphate kinase  76.09 
 
 		 140 aa  221  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0030  nucleoside diphosphate kinase  77.54 
 
 		 140 aa  219  8e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.348386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1601  nucleoside diphosphate kinase  74.64 
 
 		 140 aa  219  9e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00859967  normal  0.254258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2961  nucleoside diphosphate kinase  73.91 
 
 		 140 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0984592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2485  nucleoside diphosphate kinase  73.91 
 
 		 140 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2169  nucleoside diphosphate kinase  77.14 
 
 		 140 aa  217  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1759  nucleoside diphosphate kinase  73.91 
 
 		 140 aa  210  5.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0968  nucleoside diphosphate kinase  70.29 
 
 		 140 aa  209  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00326747 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1234  nucleoside-diphosphate kinase  71.74 
 
 		 140 aa  206  7e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0263228  normal  0.0520892 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2433  nucleoside diphosphate kinase  70.29 
 
 		 140 aa  205  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3838  nucleoside diphosphate kinase  74.64 
 
 		 140 aa  206  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.502354 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0894  nucleoside diphosphate kinase  71.01 
 
 		 140 aa  205  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.139474  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0957  nucleoside diphosphate kinase  72.46 
 
 		 140 aa  204  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0694  nucleoside diphosphate kinase  69.57 
 
 		 140 aa  202  8e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.900866  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0685  nucleoside diphosphate kinase  69.57 
 
 		 140 aa  202  8e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0237  nucleoside diphosphate kinase  67.39 
 
 		 140 aa  201  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal  0.83109 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0775  nucleoside diphosphate kinase  67.39 
 
 		 140 aa  200  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251907 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2594  nucleoside diphosphate kinase  67.39 
 
 		 140 aa  199  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.772748  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  71.01 
 
 		 140 aa  199  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1979  nucleoside diphosphate kinase  65.22 
 
 		 140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0514  nucleoside diphosphate kinase  65.94 
 
 		 140 aa  197  6e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.321088  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1127  nucleoside diphosphate kinase  72.93 
 
 		 140 aa  196  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.355617 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1311  nucleoside-diphosphate kinase  68.84 
 
 		 140 aa  195  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.298971  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2894  nucleoside diphosphate kinase  70.29 
 
 		 140 aa  195  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.588521  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1538  nucleoside diphosphate kinase  70.29 
 
 		 140 aa  195  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1350  nucleoside diphosphate kinase  71.43 
 
 		 140 aa  194  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.388595 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1746  nucleoside diphosphate kinase  70.29 
 
 		 140 aa  193  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2901  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_002978  WD1183  nucleoside diphosphate kinase  63.77 
 
 		 139 aa  192  9e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1224  nucleoside diphosphate kinase  63.77 
 
 		 140 aa  191  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131645 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1079  nucleoside diphosphate kinase  63.77 
 
 		 140 aa  191  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000368146 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1822  nucleoside diphosphate kinase  66.67 
 
 		 140 aa  190  6e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  65.22 
 
 		 143 aa  189  8e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1439  nucleoside diphosphate kinase  62.22 
 
 		 139 aa  186  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0019677  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  64.03 
 
 		 143 aa  184  5e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1552  nucleoside diphosphate kinase  66.15 
 
 		 132 aa  183  9e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.744593  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0925  nucleoside diphosphate kinase  62.96 
 
 		 139 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.621681 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2052  Nucleoside-diphosphate kinase  62.86 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3160  nucleoside diphosphate kinase  61.07 
 
 		 139 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00622384 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  61.87 
 
 		 143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2190  Nucleoside-diphosphate kinase  59.42 
 
 		 142 aa  177  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1498  nucleoside diphosphate kinase  59.71 
 
 		 143 aa  177  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300953  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  59.42 
 
 		 141 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  59.29 
 
 		 141 aa  177  5.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2389  nucleoside diphosphate kinase  61.15 
 
 		 143 aa  176  8e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00124206  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4256  nucleoside diphosphate kinase  60.71 
 
 		 143 aa  176  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2377  nucleoside diphosphate kinase  61.15 
 
 		 143 aa  176  8e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000377324  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2493  nucleoside diphosphate kinase  61.15 
 
 		 143 aa  176  8e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000115766  hitchhiker  0.00287307 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1970  nucleoside diphosphate kinase  61.15 
 
 		 143 aa  176  8e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570351  hitchhiker  0.000372949 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1301  nucleoside diphosphate kinase  59.71 
 
 		 143 aa  176  9e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378961  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2559  nucleoside diphosphate kinase  60.74 
 
 		 137 aa  176  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.17056e-35 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2141  nucleoside diphosphate kinase  61.15 
 
 		 143 aa  176  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000896706  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2862  nucleoside diphosphate kinase  59.71 
 
 		 143 aa  176  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.760882  hitchhiker  0.0000000204456 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1792  nucleoside diphosphate kinase  60.71 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1747  nucleoside diphosphate kinase  61.15 
 
 		 143 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000066664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1827  nucleoside diphosphate kinase  61.15 
 
 		 143 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00692161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1248  nucleoside diphosphate kinase  58.57 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2272  nucleoside diphosphate kinase  61.15 
 
 		 143 aa  176  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000444266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1654  nucleoside diphosphate kinase  60.74 
 
 		 137 aa  175  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000296551  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  59.71 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  58.99 
 
 		 164 aa  175  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  58.99 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2310  nucleoside diphosphate kinase  58.99 
 
 		 143 aa  174  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00703116  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2274  nucleoside diphosphate kinase  60.43 
 
 		 143 aa  174  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0731  Nucleoside-diphosphate kinase  59.71 
 
 		 143 aa  174  5e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2686  nucleoside diphosphate kinase  60.74 
 
 		 137 aa  173  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.77267e-18  normal  0.505951 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1342  nucleoside diphosphate kinase  57.97 
 
 		 139 aa  173  7e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00960069  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2890  Nucleoside-diphosphate kinase  61.54 
 
 		 138 aa  173  7e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.421827  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0899  nucleoside-diphosphate kinase  58.27 
 
 		 143 aa  173  9e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1783  nucleoside diphosphate kinase  57.55 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000760949 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0560  nucleoside diphosphate kinase  60 
 
 		 139 aa  172  9.999999999999999e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1086  nucleoside diphosphate kinase  59.42 
 
 		 141 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.895381  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1123  nucleoside diphosphate kinase  58.99 
 
 		 142 aa  171  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592805  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1402  nucleoside diphosphate kinase  58.96 
 
 		 144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000394217  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2992  nucleoside diphosphate kinase  57.55 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000780378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1580  nucleoside diphosphate kinase  60.74 
 
 		 137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000001622  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2182  nucleoside diphosphate kinase  58.7 
 
 		 146 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0849  nucleoside diphosphate kinase  60.14 
 
 		 141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0879  nucleoside diphosphate kinase  60.14 
 
 		 141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1166  nucleoside diphosphate kinase  58.7 
 
 		 141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1117  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.357968  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2368  nucleoside diphosphate kinase  58.52 
 
 		 140 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0653822  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0893  nucleoside diphosphate kinase  55.71 
 
 		 145 aa  170  5.999999999999999e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2231  nucleoside diphosphate kinase  57.86 
 
 		 147 aa  170  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00256702  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1420  nucleoside diphosphate kinase  56.43 
 
 		 141 aa  169  9e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.803456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3394  nucleoside diphosphate kinase  55.8 
 
 		 141 aa  169  9e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0084  nucleoside-diphosphate kinase  58.7 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.311434  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0377  nucleoside diphosphate kinase  58.82 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1430  nucleoside diphosphate kinase  60.43 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0233  nucleoside diphosphate kinase  59.56 
 
 		 137 aa  169  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2180  nucleoside diphosphate kinase  58.52 
 
 		 140 aa  168  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0298319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>