143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5463 on replicon NC_010721
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  823    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  46.4 
 
 		 416 aa  315  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  37.17 
 
 		 398 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  37.93 
 
 		 407 aa  241  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  38.13 
 
 		 406 aa  239  6.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  38.3 
 
 		 406 aa  237  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  41.37 
 
 		 397 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  39.19 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  37.08 
 
 		 395 aa  227  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  38.96 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  36.34 
 
 		 393 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  33.05 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  32.58 
 
 		 420 aa  197  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  33.43 
 
 		 414 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  33.43 
 
 		 414 aa  192  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  32.95 
 
 		 440 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  30.97 
 
 		 544 aa  186  7e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  30.16 
 
 		 421 aa  184  3e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  30.37 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  30.1 
 
 		 413 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  30.1 
 
 		 413 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  33.78 
 
 		 392 aa  176  8e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  33.78 
 
 		 399 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  31.81 
 
 		 424 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  29.24 
 
 		 390 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  33.14 
 
 		 384 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  29.14 
 
 		 389 aa  164  3e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  31.32 
 
 		 412 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  32.59 
 
 		 460 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  32.59 
 
 		 429 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  28.66 
 
 		 524 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  28.93 
 
 		 420 aa  159  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  30.29 
 
 		 426 aa  158  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  26.54 
 
 		 417 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  30.68 
 
 		 416 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  28.57 
 
 		 404 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  26.49 
 
 		 419 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  28.38 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  28.38 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  28.38 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  31.82 
 
 		 411 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  30.59 
 
 		 420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  29.17 
 
 		 408 aa  146  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  30.06 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  31.12 
 
 		 473 aa  142  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  29.35 
 
 		 428 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  27.01 
 
 		 434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  28.99 
 
 		 407 aa  137  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  27.45 
 
 		 423 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  29.25 
 
 		 434 aa  134  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  29.1 
 
 		 428 aa  130  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  28.21 
 
 		 431 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  26.98 
 
 		 408 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  28.45 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  27.42 
 
 		 417 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  29.78 
 
 		 407 aa  124  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  28.08 
 
 		 408 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  25.71 
 
 		 433 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  26.11 
 
 		 445 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  26.75 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  27.05 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  27.02 
 
 		 414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  22.65 
 
 		 436 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  22.65 
 
 		 436 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  24.43 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  25.81 
 
 		 447 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  29.12 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  26.55 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  27.2 
 
 		 457 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  26.86 
 
 		 441 aa  107  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  28.57 
 
 		 434 aa  106  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  23.73 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  27.47 
 
 		 833 aa  100  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  27.47 
 
 		 833 aa  100  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  27.47 
 
 		 859 aa  100  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2688  phage portal protein, HK97 family  25.82 
 
 		 464 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.912505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  26.39 
 
 		 401 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  24.41 
 
 		 411 aa  98.6  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  25.15 
 
 		 454 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  25.15 
 
 		 454 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  20.56 
 
 		 436 aa  96.3  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  23.3 
 
 		 434 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  20.99 
 
 		 413 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0013  HK97 family phage portal protein  25.57 
 
 		 393 aa  94.7  3e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2199  HK97 family portal protein , putative  32.07 
 
 		 225 aa  94.4  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1012  HK97 family phage portal protein  25.99 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.982443  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1433  HK97 family phage portal protein  27.43 
 
 		 390 aa  92  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.273066 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  24.29 
 
 		 445 aa  89.7  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  21.87 
 
 		 409 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  24.29 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1303  phage portal protein, HK97 family  28.7 
 
 		 437 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  24.42 
 
 		 429 aa  87.4  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1707  phage portal protein, HK97 family  26.7 
 
 		 390 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.449207  normal  0.0531802 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0671  HK97 family phage portal protein  24.07 
 
 		 372 aa  87.4  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0903  HK97 family phage portal protein  28.11 
 
 		 391 aa  86.3  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.580107 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1161  Phage portal protein, HK97  27.64 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1334  phage portal protein HK97 family  25.06 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00597949  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1429  phage portal protein, HK97 family  27.61 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  normal  0.284789 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1648  hypothetical protein  27.15 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117092  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1058  Phage portal protein, HK97  28.71 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0489201 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>