272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2342 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  91.01 
 
 		 392 aa  645    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2342  protein of unknown function DUF1730  100 
 
 		 356 aa  714    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.932969 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  92.26 
 
 		 349 aa  659    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  73.12 
 
 		 363 aa  497  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  72.19 
 
 		 389 aa  461  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  64.78 
 
 		 388 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  59.14 
 
 		 393 aa  439  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  61.54 
 
 		 383 aa  435  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  61.08 
 
 		 380 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  59.18 
 
 		 387 aa  421  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  58.24 
 
 		 404 aa  423  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  57.94 
 
 		 398 aa  421  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  58.02 
 
 		 383 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  58.31 
 
 		 385 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  61.36 
 
 		 382 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  56.77 
 
 		 390 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3682  iron-sulfur cluster binding protein  57.23 
 
 		 366 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.253797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0043  domain of unknown function DUF1730  58.82 
 
 		 370 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  58.81 
 
 		 383 aa  395  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  57.02 
 
 		 385 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3314  iron-sulfur cluster binding protein  57.55 
 
 		 392 aa  393  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.117611  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  59.39 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2290  hypothetical protein  62.3 
 
 		 347 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1143  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur cluster binding protein  61.98 
 
 		 348 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2784  hypothetical protein  64 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2804  hypothetical protein  61.66 
 
 		 348 aa  381  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  56.38 
 
 		 372 aa  383  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  55.79 
 
 		 375 aa  378  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0274  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  61.08 
 
 		 343 aa  375  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.097204 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2806  hypothetical protein  60.98 
 
 		 347 aa  376  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.578108 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3307  putative 4Fe-4S binding domain protein  63.06 
 
 		 344 aa  373  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1141  domain of unknown function DUF1730  61.27 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1342  hypothetical protein  64.42 
 
 		 353 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.185892  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  59.49 
 
 		 349 aa  365  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2899  putative iron-sulfur cluster binding protein  62.66 
 
 		 382 aa  363  3e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0221  hypothetical protein  61.61 
 
 		 325 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2868  4Fe-4S cluster binding  61.74 
 
 		 350 aa  354  2e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  45.16 
 
 		 438 aa  270  4e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  45.6 
 
 		 355 aa  270  4e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  44.77 
 
 		 385 aa  265  1e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1627  hypothetical protein  41.57 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  45.6 
 
 		 356 aa  264  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1172  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.04 
 
 		 332 aa  262  6e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  44.79 
 
 		 363 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.81 
 
 		 357 aa  256  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  43.73 
 
 		 354 aa  256  4e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.38 
 
 		 355 aa  255  7e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  44.59 
 
 		 380 aa  255  8e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  42.72 
 
 		 368 aa  252  6e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.01 
 
 		 362 aa  252  7e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0582  4Fe-4S cluster binding  42.68 
 
 		 393 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  44.09 
 
 		 373 aa  251  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  41.37 
 
 		 355 aa  251  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  41.07 
 
 		 369 aa  250  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0524  4Fe-4S cluster binding protein  42.9 
 
 		 377 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  hitchhiker  0.00311756 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5125  iron-sulfur cluster binding protein  41.8 
 
 		 351 aa  249  6e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0783629  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0985  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.2 
 
 		 361 aa  249  6e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0900  iron-sulfur cluster binding protein  42.59 
 
 		 360 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3461  iron-sulfur cluster binding protein  41.1 
 
 		 362 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2817  iron-sulfur cluster binding protein  44.08 
 
 		 385 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309396  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  42.9 
 
 		 361 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  45.29 
 
 		 366 aa  244  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  40.25 
 
 		 379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2411  iron-sulfur cluster binding protein  44.33 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.93 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  40.74 
 
 		 379 aa  242  6e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.61 
 
 		 397 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1713  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.24 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  42.81 
 
 		 362 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0460  hypothetical protein  40.54 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  42.81 
 
 		 362 aa  239  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  41.61 
 
 		 361 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  41.1 
 
 		 359 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0597  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.3 
 
 		 364 aa  239  5.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0524  putative 4Fe-4S ferredoxin  38.94 
 
 		 405 aa  239  6.999999999999999e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.77669  normal  0.0275938 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0519  4Fe-4S cluster binding  39.56 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0276415  decreased coverage  0.00221689 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1307  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.45 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.651952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.44 
 
 		 357 aa  237  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  45.68 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  42.53 
 
 		 354 aa  236  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3301  4Fe-4S cluster binding  41.14 
 
 		 372 aa  236  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2585  iron-sulfur cluster binding protein  41.74 
 
 		 382 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.13 
 
 		 379 aa  236  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2561  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.74 
 
 		 382 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2541  putative iron-sulfur 4Fe-4S ferredoxin protein  40.37 
 
 		 360 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1950  4Fe-4S cluster binding  41.74 
 
 		 411 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.926521  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  39.68 
 
 		 379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0724  iron-sulfur cluster binding protein, putative  42.57 
 
 		 409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602669  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  39.93 
 
 		 379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0909  putative iron-sulfur cluster-binding protein  44.95 
 
 		 409 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  38.1 
 
 		 375 aa  233  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0367  iron-sulfur cluster binding protein, putative  44.95 
 
 		 409 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1066  iron-sulfur cluster-binding protein  44.95 
 
 		 409 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.457692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0116  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.95 
 
 		 409 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2480  iron-sulfur cluster binding protein  42.61 
 
 		 411 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198365  normal  0.0353934 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2502  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.95 
 
 		 409 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.884061  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0667  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.95 
 
 		 409 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5893  4Fe-4S cluster binding protein  41.74 
 
 		 382 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.551773 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  41.27 
 
 		 354 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2609  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.32 
 
 		 368 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>