39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1893 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1893  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  300  5.000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.479923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0066  hypothetical protein  48.96 
 
 		 166 aa  103  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0701675 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2202  secreted protein-like protein  54.35 
 
 		 136 aa  95.5  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2068  hypothetical protein  36.05 
 
 		 164 aa  95.1  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1409  secreted protein  32.28 
 
 		 269 aa  87  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.894228  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2055  hypothetical protein  42.39 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.465998 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2681  secreted protein-like  41.3 
 
 		 412 aa  81.3  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.593103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2108  secreted protein-like protein  38.74 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0916  hypothetical protein  41 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.964057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1679  hypothetical protein  36.04 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.213144 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0251  hypothetical protein  38.14 
 
 		 745 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0926046  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0966  hypothetical protein  38.14 
 
 		 745 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1662  hypothetical protein  37.11 
 
 		 746 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0931092  normal  0.879448 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1239  lipoprotein  25.9 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.619168  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1461  putative lipoprotein  33.71 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.093492  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0065  hypothetical protein  39.08 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0709944 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0675  hypothetical protein  32.12 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.994925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1262  secreted protein-like protein  32.56 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13870  hypothetical protein  27.93 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4741  inhibitor of cysteine peptidase  28.97 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0304877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54220  inhibitor of cysteine peptidase  26.85 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1559  hypothetical protein  32.35 
 
 		 741 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1148  ArsR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 503 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.591964  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0706  hypothetical protein  30.43 
 
 		 201 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0929  hypothetical protein  32.73 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0056852 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3945  hypothetical protein  27.56 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5290  Proteinase inhibitor I42, chagasin  34.07 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.440506 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  30.61 
 
 		 1202 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0078  hypothetical protein  28.95 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.984341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2453  secreted protein-like protein  27.08 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0059  hypothetical protein  31.96 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0315655 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  32.88 
 
 		 316 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1222  secreted protein-like protein  34.52 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0154871 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1515  hypothetical protein  31.31 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1927  hypothetical protein  25.32 
 
 		 152 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000111149  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4211  lipoprotein, putative  27.05 
 
 		 130 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1442  hypothetical protein  30.7 
 
 		 190 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4363  putative lipoprotein  27.37 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144177  normal  0.0276166 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4279  secreted protein-like protein  33.33 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.568933  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>