53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1248 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1248  V-type ATPase, D subunit  100 
 
 		 214 aa  424  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.188247  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1224  V-type ATP synthase subunit D  48.51 
 
 		 220 aa  201  9e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.486034 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2675  V-type ATP synthase subunit D  46.31 
 
 		 213 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2343  V-type ATP synthase subunit D  47.29 
 
 		 209 aa  193  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.563261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1185  V-type ATP synthase subunit D  43.96 
 
 		 209 aa  185  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722603  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0591  V-type ATPase, D subunit  45.97 
 
 		 214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68566  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0289  V-type ATP synthase subunit D  49.26 
 
 		 208 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0384  V-type ATP synthase subunit D  44 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1366  V-type ATPase, D subunit  42.86 
 
 		 239 aa  164  6.9999999999999995e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1441  V-type ATP synthase subunit D  41.87 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0338173  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3358  V-type ATPase, D subunit  42.35 
 
 		 250 aa  162  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2766  V-type ATPase, D subunit  44.78 
 
 		 209 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1286  V-type ATP synthase subunit D  39.41 
 
 		 231 aa  161  8.000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0283  V-type ATP synthase subunit D  41.84 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1245  V-type ATP synthase subunit D  40.49 
 
 		 206 aa  159  4e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1607  V-type ATP synthase subunit D  38.66 
 
 		 232 aa  146  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0369  V-type ATP synthase subunit D  36.95 
 
 		 214 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0547  V-type ATP synthase subunit D  34.16 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1613  V-type ATP synthase subunit D  33.66 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0300  V-type ATP synthase subunit D  33.66 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0067  V-type ATP synthase subunit D  35.15 
 
 		 212 aa  115  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1757  V-type ATPase, D subunit  34.58 
 
 		 222 aa  105  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3070  V-type ATP synthase subunit D  31.75 
 
 		 220 aa  92  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1137  V-type ATPase, D subunit  31.19 
 
 		 216 aa  91.7  8e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00018509  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1607  V-type ATP synthase subunit D  32.23 
 
 		 214 aa  88.6  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0230905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1888  V-type ATP synthase subunit D  32.23 
 
 		 214 aa  88.6  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1768  V-type ATPase, D subunit  32.62 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1100  V-type ATPase, D subunit  29.95 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0860  V-type ATPase, D subunit  33.02 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1684  V-type ATP synthase subunit D  32.08 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2269  V-type ATP synthase subunit D  28.22 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2362  V-type ATP synthase subunit D  27.7 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0524  V-type ATPase, D subunit  30.3 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0258  V-type ATPase, D subunit  25.52 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1455  V-type ATPase, D subunit  30.54 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206362  normal  0.242301 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2045  V-type ATPase, D subunit  30.14 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2081  H+-transporting two-sector ATPase, D subunit  29.35 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.805056  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19380  V-type ATP synthase subunit D  25.62 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00590  vacuolar ATP synthase subunit d, putative  33.5 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0963  V-type ATPase D subunit  30.14 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.611183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1499  V-type ATPase, D subunit  27.27 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3440  V-type ATPase, D subunit  24.14 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_51058  predicted protein  25.13 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2562  V-type ATPase, D subunit  27.46 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.930332 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2761  V-type ATPase, D subunit  27.08 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329458  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88668  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  27.09 
 
 		 269 aa  51.6  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.877378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80851  vacuolar ATPase V1 domain subunit D  26.57 
 
 		 264 aa  51.6  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1204  V-type ATPase, D subunit  27.08 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00302283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2666  V-type ATPase, D subunit  26.56 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1919  V-type ATP synthase subunit D  21.57 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.487465  normal  0.936893 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1632  V-type ATPase, D subunit  23.12 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1009  V-type ATPase, D subunit  21.78 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1689  V-type ATPase, D subunit  21.5 
 
 		 209 aa  42  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.366516 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>