54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8700 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8700  replication protein C  100 
 
 		 381 aa  758    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5911  replication protein C  60.47 
 
 		 376 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.547338  normal  0.0252252 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6492  replication initiation protein RepC  28.28 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.578081  normal  0.568582 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4573  replication initiation protein RepC  26.65 
 
 		 441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5175  replication initiation protein RepC  30.43 
 
 		 402 aa  113  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.940689 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4102  replication initiation protein RepC  29.1 
 
 		 403 aa  112  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4791  replication initiation protein RepC  29.95 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0348646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5617  replication initiation protein RepC  30.71 
 
 		 403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal  0.1269 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9503  replication initiation protein RepC  27.83 
 
 		 409 aa  110  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.812496  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4709  replication initiation protein RepC  28.72 
 
 		 404 aa  109  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4728  replication initiation protein RepC  27.96 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0167719  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4356  replication initiation protein RepC  29.36 
 
 		 436 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6164  replication initiation protein RepC  27.38 
 
 		 425 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8002  replication initiation protein RepC  29.57 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9802  replication initiation protein RepC  27.64 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0001  replication initiation protein RepC  27.94 
 
 		 397 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0000780198  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0001  replication initiation protein RepC  27.94 
 
 		 397 aa  104  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0000463229  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4192  replication initiation protein RepC  27.01 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575341  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4523  replication protein C  30.47 
 
 		 541 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9003  replication initiation protein RepC  28.61 
 
 		 425 aa  98.6  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4454  replication initiation protein RepC  29.07 
 
 		 393 aa  98.6  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000305479  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6015  replication initiation protein RepC  28.31 
 
 		 404 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241299  normal  0.0884238 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4545  replication initiation protein RepC  26.53 
 
 		 401 aa  95.1  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000970049  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4279  replication initiation protein RepC  27.73 
 
 		 410 aa  94.4  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5465  replication initiation protein RepC  27.98 
 
 		 434 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728994  normal  0.335762 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7002  replication initiation protein RepC  27.99 
 
 		 404 aa  92.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5195  replication initiation protein RepC  26.7 
 
 		 434 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479009  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4585  replication initiation protein RepC  25.06 
 
 		 402 aa  90.9  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342951  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6052  replication initiation protein RepC  27.87 
 
 		 434 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7387  replication initiation protein RepC  26.99 
 
 		 403 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0522109  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3743  replication protein C  26.27 
 
 		 426 aa  87.8  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4091  replication initiation protein RepC  27.67 
 
 		 437 aa  86.3  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5557  replication initiation protein RepC  27 
 
 		 434 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.539065  normal  0.740514 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4021  replication initiation protein RepC  27.37 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0836066  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4519  replication initiation protein RepC  26.82 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3847  replication protein C  28.37 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0003  replication initiation protein RepC  28.85 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.176403 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6499  replication initiation protein RepC  25.18 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5002  replication initiation protein RepC  25.23 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5212  replication protein C  29.75 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6315  replication initiation protein RepC  26.7 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4352  replication protein C  27.79 
 
 		 510 aa  77.8  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3578  replication protein C  28.34 
 
 		 451 aa  77.4  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4534  replication initiation protein RepC  27.84 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171833  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4673  replication initiation protein RepC  29.11 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.795388  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5478  replication protein C  26.44 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7170  replication initiation protein RepC  28.92 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.611656 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3274  replication protein C  27.76 
 
 		 463 aa  75.9  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3307  replication protein C  37.04 
 
 		 463 aa  71.2  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8201  replication protein C  23.13 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3518  replication protein C  39.08 
 
 		 453 aa  63.2  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4021  replication initiation protein RepC  29.81 
 
 		 433 aa  59.7  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4539  replication protein C  37.25 
 
 		 426 aa  50.4  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9901  replication protein C  39.76 
 
 		 426 aa  46.6  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>