More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8496 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8496  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7603  hypothetical protein  87.78 
 
 		 433 aa  159  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6371  hypothetical protein  76.14 
 
 		 450 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  76.32 
 
 		 291 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1072  IS3 family transposase orfB  60 
 
 		 302 aa  105  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1010  IS3 family transposase orfB  60 
 
 		 302 aa  105  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1713  hypothetical protein  57.78 
 
 		 452 aa  104  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0194  hypothetical protein  57.78 
 
 		 452 aa  104  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1677  hypothetical protein  57.78 
 
 		 452 aa  103  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000340241 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0928  hypothetical protein  57.78 
 
 		 452 aa  103  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0364617  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3465  hypothetical protein  57.78 
 
 		 452 aa  103  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.022849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0770  hypothetical protein  57.78 
 
 		 452 aa  101  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4710  hypothetical protein  60 
 
 		 385 aa  101  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1015  IS3 family transposase orfB  60.26 
 
 		 293 aa  97.4  9e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1116  IS3 family transposase orfB  60.26 
 
 		 293 aa  97.4  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  60.87 
 
 		 285 aa  89.4  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1569  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  55.88 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.422355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  53.62 
 
 		 286 aa  77.8  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  53.62 
 
 		 286 aa  77.8  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  53.62 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  53.62 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  53.62 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  53.62 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  53.62 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  53.62 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  53.62 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  53.62 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  53.62 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  53.62 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  53.62 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0139  Integrase catalytic region  53.03 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1705  Integrase catalytic region  53.03 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1582  Integrase catalytic region  53.03 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0514  integrase catalytic subunit  48.1 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0519  integrase catalytic subunit  48.1 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0693  integrase catalytic subunit  48.1 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0702  integrase catalytic subunit  48.1 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0706  integrase catalytic subunit  48.1 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0708  integrase catalytic subunit  48.1 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2398  integrase catalytic subunit  48.1 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2400  integrase catalytic subunit  48.1 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3189  integrase catalytic subunit  48.1 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3353  integrase catalytic subunit  48.1 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.746992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4118  integrase catalytic subunit  48.1 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000189778 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  52.17 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  52.94 
 
 		 270 aa  74.3  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  52.94 
 
 		 270 aa  74.3  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  52.94 
 
 		 270 aa  74.3  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  52.94 
 
 		 270 aa  74.3  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  52.94 
 
 		 270 aa  74.3  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1536  Integrase catalytic region  45.57 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  hitchhiker  0.00036326 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0260  Integrase catalytic region  45.57 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1653  Integrase catalytic region  45.57 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  51.47 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0663  transposase  47.76 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0850  transposase  47.76 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0138656  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0854  transposase  47.76 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000400672  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0884  transposase  47.76 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.341122  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1036  transposase  47.76 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0036769  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1087  transposase  47.76 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1671  transposase  47.76 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1413  transposase  47.76 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.143794  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  51.47 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3753  hypothetical protein  62.9 
 
 		 105 aa  72  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0113248  hitchhiker  0.00544666 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  48.53 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1097  Integrase catalytic region  44.3 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  48.53 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  48.53 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0824  Integrase catalytic region  44.3 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  0.225797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  48.53 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  48.53 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  48.53 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  48.53 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  48.53 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4705  integrase catalytic subunit  52.46 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0842  Integrase catalytic region  51.52 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  48.48 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  48.48 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02990  ISxac3 transposase  47.06 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  47.06 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  47.06 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  47.06 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4612  transposase  48.53 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  0.0596523 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1356  integrase catalytic subunit  49.23 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278768 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0731  integrase catalytic subunit  49.23 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.100278  decreased coverage  0.000000433601 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1476  integrase catalytic subunit  49.23 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.725105  normal  0.179126 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1315  integrase catalytic subunit  49.23 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1028  integrase catalytic subunit  49.23 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775486 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1053  integrase catalytic subunit  49.23 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1024  integrase catalytic subunit  49.23 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659749 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1120  integrase catalytic subunit  49.23 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1358  integrase catalytic subunit  49.23 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278768 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  47.06 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2722  integrase catalytic subunit  40.58 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0928  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  48.48 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.394905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  50 
 
 		 286 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  50 
 
 		 274 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  51.56 
 
 		 296 aa  67.8  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  51.56 
 
 		 296 aa  67.8  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>