67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7180 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7180  Invasion associated locus B family protein  100 
 
 
260 aa  511  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6313  invasion associated locus B family protein  86.61 
 
 
253 aa  328  6e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3575  Invasion associated locus B family protein  69.95 
 
 
267 aa  277  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0837139  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3693  Invasion associated locus B family protein  68.72 
 
 
267 aa  270  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.468736  normal  0.931761 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3384  invasion associated locus B family protein  68.72 
 
 
267 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.877703 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1657  invasion associated locus B family protein  75.82 
 
 
257 aa  263  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3828  Invasion associated locus B family protein  60.69 
 
 
187 aa  223  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2193  invasion associated locus B family protein  62.5 
 
 
251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4152  hypothetical protein  41.99 
 
 
258 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2942  Invasion associated locus B family protein  44.57 
 
 
248 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2049  invasion associated locus B  43.5 
 
 
250 aa  135  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.49734  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2626  invasion associated locus B  43.68 
 
 
262 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.194034  decreased coverage  0.0000348412 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1509  invasion associated locus B  40 
 
 
244 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.138245  normal  0.0458793 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2846  invasion associated locus B  42.46 
 
 
263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2614  invasion associated locus B  43.9 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0807457  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0541  invasion associated locus B (IalB) protein  31.79 
 
 
205 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1396  invasion associated locus B family protein  35.93 
 
 
209 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213972  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0575  hypothetical protein  31.79 
 
 
205 aa  102  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3637  invasion associated locus B family protein  31.79 
 
 
205 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1734  Invasion associated locus B family protein  32.75 
 
 
221 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1918  Invasion associated locus B family protein  32.16 
 
 
219 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308909  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1698  invasion associated locus B  33.74 
 
 
204 aa  93.2  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2372  hypothetical protein  32.34 
 
 
211 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0466  hypothetical protein  33.69 
 
 
198 aa  89.7  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0471  hypothetical protein  33.51 
 
 
208 aa  90.1  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0800  invasion associated locus B family protein  28.4 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0580  invasion associated locus B family protein  32.84 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1038  invasion associated locus B  30.37 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0641  Invasion associated locus B family protein  29.85 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.285928 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0517  invasion associated locus B family protein  30.6 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0601  Invasion associated locus B family protein  29.85 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0740  invasion associated locus B  31.34 
 
 
172 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1236  Invasion associated locus B family protein  27.97 
 
 
185 aa  63.5  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497767 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4649  invasion associated locus B family protein  30.3 
 
 
190 aa  62.8  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372829  normal  0.231313 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0222  invasion associated locus B  27.61 
 
 
195 aa  62.4  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0587  invasion associated locus B  31.58 
 
 
186 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0857316  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2525  invasion associated locus B  27.98 
 
 
205 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0254  invasion associated locus B  28.15 
 
 
186 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3868  invasion associated locus B family protein  28.83 
 
 
267 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0566  Invasion associated locus B family protein  28.79 
 
 
190 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.165882 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4589  invasion associated locus B  26.67 
 
 
211 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0898  Invasion associated locus B family protein  26.67 
 
 
182 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0827  hypothetical protein  28.89 
 
 
203 aa  59.3  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.187418 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0813  invasion associated locus B  26.67 
 
 
214 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.181742  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4786  invasion associated locus B  25.93 
 
 
191 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.979313  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0591  invasion associated locus B family protein  28.79 
 
 
180 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.04899  normal  0.0705268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1839  Invasion associated locus B family protein  29.55 
 
 
166 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0465261  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4885  invasion associated locus B family protein  28.79 
 
 
166 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349132  normal  0.015779 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0731  invasion associated locus B family protein  25 
 
 
213 aa  58.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0602  Invasion associated locus B family protein  28.79 
 
 
180 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.100157 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0441  invasion associated locus B family protein  32.09 
 
 
172 aa  56.6  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3094  invasion associated locus B family protein  29.94 
 
 
185 aa  55.8  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.40204 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3491  invasion associated locus B family protein  28.03 
 
 
177 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482775  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1222  invasion associated locus B  27.27 
 
 
211 aa  52.4  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.307395  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1615  hypothetical protein  27.51 
 
 
196 aa  52  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.338894 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0356  invasion protein B  28.36 
 
 
184 aa  50.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1179  invasion associated locus B family protein  27.82 
 
 
172 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5187  Invasion protein B  31.62 
 
 
175 aa  46.2  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0706  invasion associated locus B  30.32 
 
 
186 aa  46.2  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0588  invasion associated locus B  36.67 
 
 
149 aa  45.4  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223596  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3254  Invasion associated locus B family protein  28.09 
 
 
236 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351607  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1007  Invasion associated locus B family protein  29.63 
 
 
176 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5047  invasion associated locus B family protein  32.58 
 
 
227 aa  43.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.413394  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0404  invasion associated locus B family protein  22.22 
 
 
179 aa  42.7  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1977  Invasion associated locus B family protein  36.47 
 
 
171 aa  42.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1701  Invasion associated locus B family protein  32.93 
 
 
212 aa  42.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1381  invasion associated locus B family protein  28.57 
 
 
262 aa  42  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0695092  normal  0.770841 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>