More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6456 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6456  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
261 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4402  enoyl-CoA hydratase  52 
 
 
257 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0994  enoyl-CoA hydratase  53.91 
 
 
273 aa  258  7e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3111  enoyl-CoA hydratase  53.91 
 
 
264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.554974  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0605  enoyl-CoA hydratase  52.05 
 
 
260 aa  248  8e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7093  enoyl-CoA hydratase  52.7 
 
 
267 aa  246  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0658855  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5283  enoyl-CoA hydratase  51.34 
 
 
263 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4798  enoyl-CoA hydratase  51.89 
 
 
265 aa  239  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109954  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1988  enoyl-CoA hydratase  51.87 
 
 
268 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138891  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2492  enoyl-CoA hydratase  54.08 
 
 
256 aa  238  5e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1886  enoyl-CoA hydratase  51.04 
 
 
268 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0955697  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3578  enoyl-CoA hydratase  51.04 
 
 
268 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0354874  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0274  enoyl-CoA hydratase  52.23 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00265078  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1561  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.79 
 
 
258 aa  233  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3020  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.9 
 
 
252 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.103578 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0923  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.97 
 
 
282 aa  222  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.191256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5093  enoyl-CoA hydratase  46.25 
 
 
263 aa  219  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382387 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2366  enoyl-CoA hydratase  44.4 
 
 
289 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000255309  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0665  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.9 
 
 
250 aa  204  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.103858  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2560  enoyl-CoA hydratase  44.58 
 
 
268 aa  191  8e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  35.18 
 
 
256 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.74 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.41 
 
 
659 aa  132  3.9999999999999996e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.8 
 
 
252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.1 
 
 
265 aa  128  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.21 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 
258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 
260 aa  125  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  35.51 
 
 
258 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.51 
 
 
258 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 
258 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  34.26 
 
 
260 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
258 aa  122  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 
267 aa  122  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0224  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.14 
 
 
254 aa  122  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  34.3 
 
 
283 aa  122  8e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1709  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.75 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.41 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  37.39 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  35.22 
 
 
258 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  34.25 
 
 
262 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.28 
 
 
257 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 
259 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.92 
 
 
258 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  36.51 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.62 
 
 
265 aa  119  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2951  short chain enoyl-CoA hydratase  33.74 
 
 
257 aa  118  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  34.4 
 
 
257 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  34.54 
 
 
257 aa  118  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.84 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.4 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.27 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1795  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.14 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.27 
 
 
260 aa  116  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  34.29 
 
 
257 aa  117  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.52 
 
 
256 aa  116  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  34.29 
 
 
257 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  33.88 
 
 
257 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2484  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.81 
 
 
257 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.585223  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  34.29 
 
 
257 aa  116  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.28 
 
 
260 aa  116  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.05 
 
 
258 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 
258 aa  116  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  34.29 
 
 
257 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  34.29 
 
 
257 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.68 
 
 
258 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0643  short chain enoyl-CoA hydratase  39.03 
 
 
265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0226779  normal  0.0998873 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  34.27 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  34.69 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  34.01 
 
 
260 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2688  enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 
258 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000000387614  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 
258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.56 
 
 
258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  35 
 
 
257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.56 
 
 
256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 
258 aa  115  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  31.23 
 
 
269 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  31.23 
 
 
269 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  31.62 
 
 
269 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  32.13 
 
 
257 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  34.36 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3571  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.18 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  35 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.62 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  34.4 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.56 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.44 
 
 
259 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  34.82 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.05 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  30.61 
 
 
258 aa  113  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
259 aa  113  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  34.39 
 
 
257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.65 
 
 
270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  35.95 
 
 
251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>