More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3169 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
344 aa  700    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  86.63 
 
 
344 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  32.73 
 
 
322 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4024  glycosyl transferase family protein  31.83 
 
 
322 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  32.83 
 
 
325 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  35.66 
 
 
328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5040  glycosyl transferase family 2  27.22 
 
 
323 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0567661 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 
528 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 
321 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5246  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
348 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0170348 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 
344 aa  99.8  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 
344 aa  99.8  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
311 aa  99.4  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  27.03 
 
 
337 aa  97.1  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2354  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 
297 aa  96.7  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.358669  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  29.93 
 
 
328 aa  96.3  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  32.76 
 
 
333 aa  96.3  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 
477 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3168  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.07 
 
 
333 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 
924 aa  92.8  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  33.46 
 
 
301 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1987  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.68 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1386  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.68 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.343804  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2274  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.68 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102891  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3039  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.68 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1010  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.68 
 
 
333 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374388  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1298  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.68 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.472979  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 
328 aa  90.5  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 
305 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6038  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 
333 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6397  glycosyl transferase family protein  33.21 
 
 
333 aa  90.1  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441453  normal  0.138484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1382  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 
333 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6447  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 
333 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  32.43 
 
 
792 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
753 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4588  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 
307 aa  88.6  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.151626  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 
305 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  32.99 
 
 
315 aa  87.8  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5649  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 
333 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0900976  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2063  glycosyl transferase family 2  31.84 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
513 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.99 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
413 aa  84  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
313 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  29.8 
 
 
455 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5443  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  hitchhiker  0.00908127 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  26.7 
 
 
316 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0518  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 
341 aa  82  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 
328 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 
328 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
470 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  26.96 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1004  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 
470 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1021  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 
470 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 
470 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  29.64 
 
 
470 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1031  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 
470 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0821008  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0155  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08321  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.389273  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
841 aa  79.7  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  29.23 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
1340 aa  77.8  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  31.47 
 
 
838 aa  76.6  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
880 aa  76.3  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0010  glycosyl transferase family protein  35.48 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.591764  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
311 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 
345 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2462  glycosyl transferase family 2  27.37 
 
 
421 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.278728  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  34.36 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  32.52 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  40.65 
 
 
240 aa  73.6  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  31.4 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  39.25 
 
 
891 aa  73.2  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08121  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0011  glycosyl transferase family 2  26.81 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000912491 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  29.81 
 
 
841 aa  72.4  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 
310 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 
320 aa  72  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 
260 aa  72.4  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  24.62 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 
430 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 
311 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  27.85 
 
 
411 aa  72  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3324  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
487 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.624929 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 
1435 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4143  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.89997 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0428  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 
438 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>