More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2062 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2062  transport system permease protein  100 
 
 		 361 aa  700    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3298  transport system permease protein  56.92 
 
 		 329 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2701  transport system permease protein  58.68 
 
 		 374 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1808  transport system permease protein  48.98 
 
 		 368 aa  296  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.537054  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1622  transport system permease protein  36.29 
 
 		 366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  34.78 
 
 		 365 aa  176  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0852  iron-enterobactin transporter permease  41.88 
 
 		 355 aa  175  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2205  transport system permease protein  36.92 
 
 		 363 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  hitchhiker  0.000202612 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1806  transport system permease protein  36.84 
 
 		 350 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0337  ABC-type enterobactin transport system inner membrane subunit  38.98 
 
 		 346 aa  169  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738203  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0141  transport system permease protein  37.67 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3466  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  36.7 
 
 		 368 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535674 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2690  transport system permease protein  36.34 
 
 		 354 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.027159  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  33.92 
 
 		 350 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3784  transport system permease protein  35.28 
 
 		 339 aa  159  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764686 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1240  transport system permease protein  34.52 
 
 		 356 aa  159  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1449  transport system permease protein  38.41 
 
 		 347 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.574166  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3139  transport system permease protein  41.35 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00243696  normal  0.0777655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5946  transport system permease protein  33.53 
 
 		 356 aa  155  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5335  transport system permease protein  35.18 
 
 		 361 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  33.86 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3757  transport system permease protein  35.18 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.236422  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3534  transport system permease protein  36.12 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0426  transport system permease protein  33.23 
 
 		 355 aa  153  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20800  ABC-type enterobactin transport system, permease component  32.92 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  33.86 
 
 		 352 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  36.69 
 
 		 345 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0332  transport system permease protein  37.82 
 
 		 394 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1985  transport system permease protein  33.33 
 
 		 348 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181756  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  33.54 
 
 		 352 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  33.54 
 
 		 352 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  33.54 
 
 		 352 aa  149  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  33.54 
 
 		 352 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  33.54 
 
 		 352 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4082  transport system permease protein  36.15 
 
 		 348 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.08527  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 		 352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 		 352 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7987  ferric enterobactin transport protein FepG  36.1 
 
 		 366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.333013  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4512  transport system permease protein  35.99 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.136565 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0307  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  35.83 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  32.91 
 
 		 352 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7289  ABC transporter  38.44 
 
 		 327 aa  143  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2422  transport system permease protein  33.33 
 
 		 355 aa  142  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000852426  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4232  transport system permease protein  37.5 
 
 		 347 aa  142  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  31.15 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  29.71 
 
 		 343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5054  transport system permease protein  37.05 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0465  transport system permease protein  34.59 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  30.84 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  33.66 
 
 		 338 aa  140  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  32.48 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  32.48 
 
 		 346 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0780  iron compound ABC transporter, permease protein  30.19 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.198362  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0101  transport system permease protein  34.27 
 
 		 331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000423595  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0105  transport system permease protein  34.27 
 
 		 331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  32.49 
 
 		 338 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3152  transport system permease protein  35.49 
 
 		 346 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309752  hitchhiker  0.000000000937793 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  33.01 
 
 		 338 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  33.01 
 
 		 338 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  32.18 
 
 		 338 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1629  transport system permease protein  33.82 
 
 		 350 aa  139  7.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.286622  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  32.49 
 
 		 338 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  32.49 
 
 		 338 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  32.49 
 
 		 338 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  32.49 
 
 		 338 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3069  ferric enterobactin transport system permease protein FepG  39.03 
 
 		 346 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.605614  normal  0.369476 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  32.18 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2436  transport system permease protein  37.69 
 
 		 344 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.237852  unclonable  0.000000000541078 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20810  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  37.08 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00921344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5109  iron-enterobactin transporter membrane protein  35.74 
 
 		 335 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.558445  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0100  transport system permease protein  32.34 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0102196  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0104  transport system permease protein  32.34 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000364541  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  30.51 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  35.06 
 
 		 326 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1775  iron compound ABC transporter, permease protein  31.33 
 
 		 321 aa  137  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  32.93 
 
 		 338 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4299  transport system permease protein  36.14 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352275  decreased coverage  0.0000200098 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3637  transport system permease protein  32.06 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  normal  0.0127485 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3059  transport system permease protein  38.61 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.128595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2721  transport system permease protein  31.58 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06009  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  32.7 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2821  transport system permease protein  37.18 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  32.51 
 
 		 347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3712  transport system permease protein  35.22 
 
 		 318 aa  134  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  32.35 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1910  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.79 
 
 		 704 aa  134  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3731  transport system permease protein  34.32 
 
 		 339 aa  134  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0415  transport system permease protein  36.48 
 
 		 346 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3527  transport system permease protein  33.92 
 
 		 347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369095  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04154  iron-dicitrate transporter subunit  36.56 
 
 		 318 aa  133  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4865  iron-dicitrate transporter subunit FecD  36.56 
 
 		 318 aa  133  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  32.35 
 
 		 340 aa  133  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04117  hypothetical protein  36.56 
 
 		 318 aa  133  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  35.9 
 
 		 312 aa  133  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0740  iron-dicitrate transporter subunit FecD  36.56 
 
 		 318 aa  133  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  33.12 
 
 		 334 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  32.06 
 
 		 340 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4085  transport system permease protein  32.65 
 
 		 345 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2825  transport system permease protein  35.53 
 
 		 344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5110  iron-enterobactin transporter permease  34.58 
 
 		 339 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>