More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5109 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5109  iron-enterobactin transporter membrane protein  100 
 
 
335 aa  619  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.558445  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20810  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  72.19 
 
 
339 aa  390  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00921344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3785  transport system permease protein  69.67 
 
 
336 aa  348  8e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000721562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2722  transport system permease protein  69.74 
 
 
332 aa  322  8e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37320  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  49.5 
 
 
374 aa  221  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2423  transport system permease protein  45.96 
 
 
347 aa  206  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0291277 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1326  transport system permease protein  44.04 
 
 
358 aa  202  5e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0395439  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0644  transport system permease protein  44.48 
 
 
342 aa  202  8e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0338  ABC-type Fe3+-siderophore transport system inner membrane subunit  49.83 
 
 
366 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552236  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1122  iron-enterobactin transporter membrane protein  46.93 
 
 
338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.122202  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02570  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  46.6 
 
 
351 aa  199  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.103691  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3730  transport system permease protein  40.97 
 
 
350 aa  199  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36340  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  45.05 
 
 
368 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  42.76 
 
 
334 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  40 
 
 
350 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0675  iron-enterobactin transporter membrane protein  46.05 
 
 
334 aa  190  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0641  iron-enterobactin transporter membrane protein  46.05 
 
 
334 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0492  iron-enterobactin transporter membrane protein  46.05 
 
 
334 aa  190  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3036  transport system permease protein  45.72 
 
 
334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  36.89 
 
 
322 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  36.89 
 
 
322 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1497  transport system permease protein  41.4 
 
 
348 aa  189  5.999999999999999e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0836152  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1623  transport system permease protein  45.4 
 
 
354 aa  189  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00557  iron-enterobactin transporter subunit  45.72 
 
 
334 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3054  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.72 
 
 
334 aa  188  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00546  hypothetical protein  45.72 
 
 
334 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0645  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.07 
 
 
335 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.997729  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3424  iron-enterobactin transporter membrane protein  42.9 
 
 
357 aa  188  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.320644  normal  0.302372 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.72 
 
 
334 aa  188  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.72 
 
 
334 aa  188  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0750  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.07 
 
 
335 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0631  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.07 
 
 
335 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0688  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.07 
 
 
335 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.690213 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0704  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.07 
 
 
335 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.525621  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0425  transport system permease protein  36.86 
 
 
335 aa  184  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.639871 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2206  transport system permease protein  45.72 
 
 
344 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0665344  hitchhiker  0.000185763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5055  transport system permease protein  46 
 
 
333 aa  183  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2818  transport system permease protein  45.66 
 
 
344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  38.82 
 
 
329 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4289  transport system permease protein  46.56 
 
 
354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993131  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06480  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  44.04 
 
 
346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368243  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5336  transport system permease protein  41.95 
 
 
347 aa  180  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1241  transport system permease protein  46.45 
 
 
353 aa  179  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00596239  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  37.67 
 
 
334 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3467  transport system permease protein  41.33 
 
 
341 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743348  hitchhiker  0.00246309 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  37.67 
 
 
340 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  37.67 
 
 
334 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  37.67 
 
 
340 aa  176  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0744  iron compound ABC transporter, permease protein  37.67 
 
 
334 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  36.74 
 
 
347 aa  175  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  37.67 
 
 
340 aa  175  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2748  transport system permease protein  43.08 
 
 
335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2435  transport system permease protein  35.83 
 
 
340 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  unclonable  0.00000000058625 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  37.25 
 
 
333 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  33.74 
 
 
351 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  33.74 
 
 
351 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0530  transport system permease protein  36.06 
 
 
334 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00110825  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  33.74 
 
 
351 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  33.74 
 
 
351 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  33.74 
 
 
351 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  33.74 
 
 
351 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 
351 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 
351 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  37.79 
 
 
336 aa  169  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  37.83 
 
 
333 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0356  transport system permease protein  42.39 
 
 
353 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5748  transport system permease protein  40.26 
 
 
337 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0653  iron compound ABC transporter, permease protein  35.76 
 
 
334 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000463622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4684  iron compound ABC transporter, permease protein  35.76 
 
 
334 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.055956  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0779  iron compound ABC transporter, permease protein  33.9 
 
 
334 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100059  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4040  transport system permease protein  40.36 
 
 
344 aa  165  9e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0684  iron compound ABC transporter, permease protein  38.01 
 
 
334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2438  transport system permease protein  39.74 
 
 
363 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4083  transport system permease protein  37.27 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00175195  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2939  transport system permease protein  38.39 
 
 
329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  38.51 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  33.74 
 
 
350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2689  transport system permease protein  43.19 
 
 
332 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0405482  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3934  transport system permease protein  42.34 
 
 
352 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5947  transport system permease protein  40.06 
 
 
362 aa  159  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2492  transport system permease protein  36.39 
 
 
340 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.3582 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0795  iron compound ABC transporter, permease protein  32.89 
 
 
337 aa  159  7e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0863815  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0808  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuB  32.89 
 
 
337 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  30.5 
 
 
343 aa  157  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2553  transport system permease protein  42.38 
 
 
366 aa  156  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0828136  normal  0.763173 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3528  transport system permease protein  41.46 
 
 
336 aa  155  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0903182  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2415  transport system permease protein  38.44 
 
 
333 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2065  transport system permease protein  39.09 
 
 
332 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1807  transport system permease protein  37.84 
 
 
336 aa  153  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2172  transport system permease protein  40.74 
 
 
349 aa  153  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0830561  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3734  transport system permease protein  41.61 
 
 
363 aa  152  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0105  transport system permease protein  31.37 
 
 
331 aa  152  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0101  transport system permease protein  31.37 
 
 
331 aa  152  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000423595  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2591  transport system permease protein  36.88 
 
 
329 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35861  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0851  transport system permease protein  35.82 
 
 
351 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2742  transport system permease protein  40.2 
 
 
366 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00162968  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3637  transport system permease protein  34.97 
 
 
340 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  normal  0.0127485 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2086  transport system permease protein  35.35 
 
 
332 aa  150  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.180942  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2669  transport system permease protein  37.57 
 
 
340 aa  150  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7290  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  33.99 
 
 
342 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>