More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2057 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
352 aa  702    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.239018  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.7 
 
 
350 aa  452  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3552  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, permease protein  60.98 
 
 
349 aa  391  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4039  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter permease  60.98 
 
 
349 aa  391  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.98 
 
 
349 aa  391  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.2 
 
 
340 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.67 
 
 
346 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0835992  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.19 
 
 
360 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.36 
 
 
347 aa  359  5e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.54 
 
 
356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.46 
 
 
352 aa  326  3e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.26 
 
 
356 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642947  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.26 
 
 
356 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00157663  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5713  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.54 
 
 
356 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.076951 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1252  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  49.23 
 
 
356 aa  324  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3866  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.18 
 
 
346 aa  322  4e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.92 
 
 
356 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0210654  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.62 
 
 
356 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.598069 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.69 
 
 
352 aa  318  6e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0522734  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1443  ABC transporter, permease protein  48.31 
 
 
330 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.86 
 
 
356 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1905  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.34 
 
 
365 aa  317  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.074595  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1310  ABC transporter, permease protein  49.54 
 
 
356 aa  316  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0196  peptide/opine/nickel ABC transporter inner membrane protein  48.77 
 
 
356 aa  316  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0448682 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1391  ABC transporter, permease protein  49.54 
 
 
356 aa  316  4e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0350688  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0248  ABC transporter, permease protein  49.54 
 
 
356 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1049  ABC transporter, permease protein  49.54 
 
 
356 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0519  ABC transporter, permease protein  49.54 
 
 
356 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1275  ABC transporter, permease protein  49.54 
 
 
336 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.572487  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.69 
 
 
356 aa  315  7e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.18 
 
 
346 aa  315  9e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2561  ABC transporter, permease protein  49.23 
 
 
356 aa  315  9e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3887  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  46.46 
 
 
355 aa  314  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.99 
 
 
356 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.66 
 
 
383 aa  312  5.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.39 
 
 
336 aa  311  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.52 
 
 
356 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.112359  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.92 
 
 
364 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1249  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.79 
 
 
352 aa  309  5.9999999999999995e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2705  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.02 
 
 
345 aa  308  6.999999999999999e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3536  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.87 
 
 
355 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.857231 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.71 
 
 
351 aa  305  7e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100967  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.19 
 
 
347 aa  305  8.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0789045  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.69 
 
 
356 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0806  ABC dipeptide transporter, inner membrane subunit DppB  49.69 
 
 
356 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.557497  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1918  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  48.16 
 
 
333 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.47 
 
 
358 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.1 
 
 
369 aa  301  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166157  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1029  dipeptide ABC transporter, permease protein  46.63 
 
 
357 aa  300  2e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.234633  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.54 
 
 
336 aa  295  7e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.1 
 
 
337 aa  295  7e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.63 
 
 
342 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.240236  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.27 
 
 
345 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.716973 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.7 
 
 
355 aa  291  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.01 
 
 
342 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162218  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.42 
 
 
355 aa  289  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.800769  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0800  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.31 
 
 
356 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3249  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB, putative  47.9 
 
 
345 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0957202  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.63 
 
 
365 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285903  normal  0.173747 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5441  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.63 
 
 
364 aa  266  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.582701  hitchhiker  0.00744073 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.61 
 
 
338 aa  249  7e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 
333 aa  241  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  40.5 
 
 
336 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.5 
 
 
335 aa  238  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  38.94 
 
 
336 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.81 
 
 
337 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298379  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  40.19 
 
 
336 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  40.19 
 
 
336 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  40.19 
 
 
336 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.94 
 
 
336 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.94 
 
 
336 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  39.25 
 
 
336 aa  235  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  38.63 
 
 
336 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  40.81 
 
 
336 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  38.63 
 
 
336 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  38.63 
 
 
336 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.63 
 
 
336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  38.63 
 
 
336 aa  233  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  38.01 
 
 
336 aa  233  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.38 
 
 
336 aa  231  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.94 
 
 
336 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0717  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, permease protein  39.25 
 
 
337 aa  229  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529173  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  37.89 
 
 
337 aa  229  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  40.19 
 
 
336 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  38.63 
 
 
336 aa  228  8e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0257  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  39.88 
 
 
336 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0183254  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
334 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103751  normal  0.0395583 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0438  dipeptide ABC transporter, permease protein  39.88 
 
 
336 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287178  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.94 
 
 
336 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.92 
 
 
335 aa  227  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0244  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  39.88 
 
 
336 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0391  Nickel-transporting ATPase  36.18 
 
 
334 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.941274  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.94 
 
 
336 aa  227  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3377  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.25 
 
 
338 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2120  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.25 
 
 
338 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192679  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
334 aa  226  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1081  peptide ABC transporter, permease protein  38.72 
 
 
337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.446829  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  39.56 
 
 
336 aa  226  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3302  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.25 
 
 
338 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2970  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.25 
 
 
338 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>