299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_3006 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_3006  ribonuclease PH  100 
 
 		 238 aa  479  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0167  ribonuclease PH  68.64 
 
 		 242 aa  326  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3641  ribonuclease PH  66.95 
 
 		 240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0469  ribonuclease PH  63.14 
 
 		 237 aa  307  9e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.221251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0401  ribonuclease PH  62.71 
 
 		 237 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3580  ribonuclease PH  61.86 
 
 		 238 aa  301  7.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0434  ribonuclease PH  62.71 
 
 		 237 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197772  normal  0.874562 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0010  ribonuclease PH  62.34 
 
 		 239 aa  301  8.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167054 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4253  ribonuclease PH  63.56 
 
 		 237 aa  299  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2151  ribonuclease PH  61.44 
 
 		 237 aa  299  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0397  ribonuclease PH  61.09 
 
 		 239 aa  298  7e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0778  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 237 aa  296  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225332  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0006  ribonuclease PH  61.51 
 
 		 239 aa  295  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.105449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4763  ribonuclease PH  61.86 
 
 		 237 aa  294  7e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125649  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0193  ribonuclease PH  61.44 
 
 		 237 aa  293  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0395  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 237 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2535  ribonuclease PH  60.17 
 
 		 237 aa  293  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0425  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 237 aa  292  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0006  ribonuclease PH  60.67 
 
 		 239 aa  292  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173681 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0186  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 237 aa  292  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0151  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 237 aa  291  6e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0167  ribonuclease PH  62.45 
 
 		 238 aa  290  2e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0332  ribonuclease PH  60.17 
 
 		 237 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0178765  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0182  ribonuclease PH  62.03 
 
 		 238 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3463  ribonuclease PH  61.28 
 
 		 237 aa  289  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0173  ribonuclease PH  62.03 
 
 		 238 aa  288  5.0000000000000004e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0325  ribonuclease PH  59.66 
 
 		 239 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2943  ribonuclease PH  61.86 
 
 		 237 aa  287  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0254  ribonuclease PH  62.71 
 
 		 238 aa  286  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4016  ribonuclease PH  62.03 
 
 		 238 aa  286  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.761364  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1664  ribonuclease PH  64.76 
 
 		 243 aa  285  4e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0567  ribonuclease PH  68.29 
 
 		 238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2658  ribonuclease PH  59.32 
 
 		 237 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.624871  normal  0.811384 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0010  ribonuclease PH  57.63 
 
 		 241 aa  281  8.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 238 aa  280  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1221  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0468806  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2882  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 237 aa  279  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2589  ribonuclease PH  58.47 
 
 		 238 aa  278  4e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.704715  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2082  ribonuclease PH  63.83 
 
 		 248 aa  276  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.362481 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  60.43 
 
 		 241 aa  276  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 238 aa  275  6e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001827  ribonuclease PH  56.36 
 
 		 238 aa  275  7e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0308379  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2872  ribonuclease PH  57.45 
 
 		 237 aa  274  9e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.51038  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  58.23 
 
 		 244 aa  273  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  56.36 
 
 		 238 aa  273  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  55.93 
 
 		 242 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  58.23 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00648  ribonuclease PH  55.93 
 
 		 240 aa  273  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2960  ribonuclease PH  55.27 
 
 		 239 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3443  ribonuclease PH  58.23 
 
 		 239 aa  271  6e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12235  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3507  ribonuclease PH  58.23 
 
 		 239 aa  271  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3361  ribonuclease PH  58.23 
 
 		 239 aa  270  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.32981  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  57.2 
 
 		 238 aa  270  1e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  55.93 
 
 		 246 aa  269  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  57.87 
 
 		 243 aa  268  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  57.38 
 
 		 241 aa  267  8e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  57.14 
 
 		 239 aa  267  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 253 aa  266  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  56.54 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0051  ribonuclease PH  56.49 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264051  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  58.47 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3425  ribonuclease PH  57.56 
 
 		 238 aa  265  4e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  56.78 
 
 		 238 aa  265  5e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2061  ribonuclease PH  60.35 
 
 		 227 aa  265  5e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0852  ribonuclease PH  56.36 
 
 		 238 aa  265  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159871  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3024  ribonuclease PH  55.04 
 
 		 243 aa  264  8e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  58.05 
 
 		 241 aa  264  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  55.93 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3683  ribonuclease PH  56.6 
 
 		 239 aa  263  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0449428 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  57.2 
 
 		 238 aa  262  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  56.78 
 
 		 238 aa  262  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  57.2 
 
 		 238 aa  262  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  57.2 
 
 		 238 aa  262  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  57.2 
 
 		 238 aa  262  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  57.2 
 
 		 238 aa  262  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  57.2 
 
 		 238 aa  262  3e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4144  ribonuclease PH  57.2 
 
 		 238 aa  262  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00364124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0062  ribonuclease PH  57.2 
 
 		 238 aa  262  4e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  55.51 
 
 		 238 aa  262  4e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0043  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 238 aa  262  4e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2477  ribonuclease PH  55.93 
 
 		 239 aa  261  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.804398  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  54.66 
 
 		 246 aa  261  6e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  56.54 
 
 		 238 aa  260  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  53.81 
 
 		 237 aa  260  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  55.51 
 
 		 238 aa  260  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  55.93 
 
 		 243 aa  260  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  55.93 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  56.71 
 
 		 243 aa  259  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 238 aa  259  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0477  RNAse PH  56.6 
 
 		 244 aa  259  3e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  56.78 
 
 		 244 aa  259  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  54.66 
 
 		 237 aa  259  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4121  ribonuclease PH  56.12 
 
 		 238 aa  258  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3933  ribonuclease PH  56.12 
 
 		 238 aa  258  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  hitchhiker  0.0000391387 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3951  ribonuclease PH  56.12 
 
 		 238 aa  258  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  56.12 
 
 		 238 aa  258  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.944116 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 246 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4014  ribonuclease PH  56.12 
 
 		 238 aa  258  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0206  ribonuclease PH  59.9 
 
 		 209 aa  258  6e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.833302 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0096  ribonuclease PH  56.54 
 
 		 238 aa  258  6e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.50257  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>