More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2101 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
317 aa  637    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  51.92 
 
 
341 aa  316  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  51.28 
 
 
341 aa  311  9e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  50.96 
 
 
341 aa  310  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  51.61 
 
 
337 aa  309  2.9999999999999997e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  50.16 
 
 
341 aa  291  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  49.52 
 
 
341 aa  288  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  50.32 
 
 
330 aa  285  5e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  50.94 
 
 
340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  48.43 
 
 
341 aa  283  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  49.02 
 
 
327 aa  280  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3410  ArsR family transcriptional regulator  52.75 
 
 
329 aa  277  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0187563  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  47.9 
 
 
328 aa  276  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  50.16 
 
 
349 aa  276  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  49.02 
 
 
339 aa  275  8e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  48.37 
 
 
342 aa  269  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  47.59 
 
 
354 aa  263  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  47.87 
 
 
349 aa  262  6e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  46.73 
 
 
340 aa  258  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  47.65 
 
 
337 aa  256  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  46.84 
 
 
324 aa  243  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  46.1 
 
 
335 aa  240  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
341 aa  210  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  45.66 
 
 
323 aa  202  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  38.85 
 
 
328 aa  188  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  38.11 
 
 
307 aa  172  9e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 
312 aa  163  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  36.81 
 
 
309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
348 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  35.25 
 
 
305 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  34.67 
 
 
306 aa  149  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  34.81 
 
 
307 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 
307 aa  142  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 
305 aa  142  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
310 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  32.48 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
309 aa  132  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  34.92 
 
 
311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  33.92 
 
 
304 aa  125  9e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  34.39 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0173  transcriptional regulator, ArsR family  35.02 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  34.97 
 
 
331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0162  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 
326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0160  methyltransferase type 11  34.3 
 
 
322 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0747842 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0155  ArsR family transcriptional regulator  35.02 
 
 
326 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
312 aa  106  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  30.87 
 
 
330 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  32.08 
 
 
331 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  32.42 
 
 
329 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
330 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
330 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
333 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  28.62 
 
 
333 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4793  regulatory protein, ArsR  31.74 
 
 
331 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
331 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
334 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  31.34 
 
 
309 aa  94  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
309 aa  94  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  27.93 
 
 
336 aa  91.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0500  ArsR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
330 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  29.65 
 
 
206 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  34.46 
 
 
212 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.16 
 
 
420 aa  90.9  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  26.33 
 
 
335 aa  88.2  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  30.15 
 
 
206 aa  85.5  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.17 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1773  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.81 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.59 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
211 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  35.25 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38 
 
 
296 aa  68.9  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  30 
 
 
271 aa  68.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00915266  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.3 
 
 
251 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.93 
 
 
260 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  34.81 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3895  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.3 
 
 
251 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.4649  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0431  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.3 
 
 
251 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159062  hitchhiker  0.0000667 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0461  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  33.54 
 
 
251 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0445  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.3 
 
 
251 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187756  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0506  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.3 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  44.79 
 
 
137 aa  68.2  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  46.58 
 
 
102 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
280 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3551  demethylmenaquinone methyltransferase  32.92 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0405  demethylmenaquinone methyltransferase  32.92 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.403287  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3725  demethylmenaquinone methyltransferase  32.92 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
111 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3202  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  33.54 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4199  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  32.3 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.57 
 
 
293 aa  67  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  36 
 
 
262 aa  67  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.38 
 
 
259 aa  67  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  34.48 
 
 
629 aa  67  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 
129 aa  67  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  43.84 
 
 
115 aa  67  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  40.82 
 
 
114 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  40.82 
 
 
114 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  36.17 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  36.17 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>