56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1897 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1897  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  404  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.169609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3039  hypothetical protein  63.24 
 
 		 204 aa  254  8e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1384  hypothetical protein  57.58 
 
 		 197 aa  209  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0576  hypothetical protein  57.95 
 
 		 197 aa  202  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3105  hypothetical protein  53.66 
 
 		 204 aa  181  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.27509  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2934  membrane-like protein  65.16 
 
 		 188 aa  176  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2734  hypothetical protein  54.36 
 
 		 190 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1398  hypothetical protein  52.9 
 
 		 190 aa  143  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259428  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1372  hypothetical protein  48.17 
 
 		 174 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1852  hypothetical protein  49.35 
 
 		 166 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2966  hypothetical protein  41.14 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280918  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0886  transcription antitermination protein NusG  41.45 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  hitchhiker  0.00000687026 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2838  membrane protein  36.31 
 
 		 166 aa  92  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768899  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4342  hypothetical protein  28.57 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.121402 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4495  hypothetical protein  25.22 
 
 		 410 aa  55.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122524  normal  0.0576102 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3325  hypothetical protein  25.65 
 
 		 410 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4624  hypothetical protein  24.78 
 
 		 412 aa  52  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_004310  BR0353  hypothetical protein  24.67 
 
 		 414 aa  51.6  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3294  hypothetical protein  23.21 
 
 		 407 aa  51.6  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.198313  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1781  protein of unknown function DUF989  24.8 
 
 		 438 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.201182 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0455  hypothetical protein  24.35 
 
 		 411 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2837  hypothetical protein  24.11 
 
 		 404 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0835  protein of unknown function DUF989  23.91 
 
 		 398 aa  49.7  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.510797  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3615  hypothetical protein  21.17 
 
 		 442 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3268  hypothetical protein  23.56 
 
 		 406 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.152004 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3914  hypothetical protein  36.62 
 
 		 415 aa  48.5  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1932  protein of unknown function DUF989  22.57 
 
 		 425 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0776481 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2255  protein of unknown function DUF989  22.57 
 
 		 418 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3583  class I monoheme cytochrome c  21.78 
 
 		 406 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.22446  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4289  hypothetical protein  20.72 
 
 		 446 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4873  hypothetical protein  37.97 
 
 		 401 aa  46.2  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3853  hypothetical protein  20.72 
 
 		 442 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0186652  normal  0.587321 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1579  hypothetical protein  20.72 
 
 		 442 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1702  hypothetical protein  21.17 
 
 		 437 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.317159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2430  hypothetical protein  24.78 
 
 		 404 aa  45.4  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1391  hypothetical protein  37.84 
 
 		 438 aa  45.4  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.196967  normal  0.0829452 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1142  hypothetical protein  22.71 
 
 		 406 aa  45.1  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3889  hypothetical protein  21.33 
 
 		 408 aa  45.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.619788 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3141  protein of unknown function DUF989  23.48 
 
 		 412 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3207  protein of unknown function DUF989  30.99 
 
 		 410 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.175006 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02521  predicted membrane protein  23.81 
 
 		 426 aa  43.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.216294  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1958  hypothetical protein  31.08 
 
 		 397 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2115  hypothetical protein  23.01 
 
 		 414 aa  42.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.766441  normal  0.766532 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2869  protein of unknown function DUF989  32.39 
 
 		 412 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.492363 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1982  hypothetical protein  31.08 
 
 		 397 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0964885 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6120  hypothetical protein  31.08 
 
 		 397 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469522  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0780  putative transmembrane protein  31.08 
 
 		 399 aa  42  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3478  hypothetical protein  29.58 
 
 		 419 aa  42  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.300585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2529  hypothetical protein  32.43 
 
 		 400 aa  41.6  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0707182  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2384  hypothetical protein  32.43 
 
 		 400 aa  41.6  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.739988  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2426  hypothetical protein  32.43 
 
 		 400 aa  41.6  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2611  hypothetical protein  30.99 
 
 		 413 aa  41.6  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0780  hypothetical protein  24.69 
 
 		 408 aa  41.6  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1873  hypothetical protein  29.73 
 
 		 397 aa  41.2  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.147429  normal  0.121684 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1946  hypothetical protein  29.73 
 
 		 397 aa  41.2  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0357  hypothetical protein  24.02 
 
 		 405 aa  41.2  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.155454 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>