21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2934 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2934  membrane-like protein  100 
 
 		 188 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2734  hypothetical protein  68.09 
 
 		 190 aa  221  4e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0576  hypothetical protein  65.31 
 
 		 197 aa  211  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1384  hypothetical protein  64.63 
 
 		 197 aa  206  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1897  hypothetical protein  56.78 
 
 		 202 aa  201  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.169609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1398  hypothetical protein  61.78 
 
 		 190 aa  194  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259428  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3039  hypothetical protein  58.23 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3105  hypothetical protein  51.78 
 
 		 204 aa  165  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.27509  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1852  hypothetical protein  49.35 
 
 		 166 aa  141  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1372  hypothetical protein  49.08 
 
 		 174 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0886  transcription antitermination protein NusG  45.1 
 
 		 212 aa  118  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  hitchhiker  0.00000687026 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2966  hypothetical protein  41.51 
 
 		 236 aa  99  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280918  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2838  membrane protein  35.62 
 
 		 166 aa  98.2  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768899  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4342  hypothetical protein  38.1 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.121402 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0835  protein of unknown function DUF989  22.61 
 
 		 398 aa  45.1  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.510797  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1982  hypothetical protein  24.36 
 
 		 397 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0964885 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1958  hypothetical protein  24.36 
 
 		 397 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6120  hypothetical protein  24.36 
 
 		 397 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469522  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5269  hypothetical protein  24.36 
 
 		 397 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3853  hypothetical protein  22.03 
 
 		 442 aa  42  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0186652  normal  0.587321 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3709  hypothetical protein  35.71 
 
 		 394 aa  42  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191189  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>