28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0576 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0576  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  389  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1384  hypothetical protein  91.88 
 
 		 197 aa  366  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3039  hypothetical protein  61.39 
 
 		 204 aa  229  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1897  hypothetical protein  57.58 
 
 		 202 aa  209  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.169609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2734  hypothetical protein  57.75 
 
 		 190 aa  195  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2934  membrane-like protein  65.31 
 
 		 188 aa  189  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1398  hypothetical protein  60.53 
 
 		 190 aa  174  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259428  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3105  hypothetical protein  52.04 
 
 		 204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.27509  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1372  hypothetical protein  49.69 
 
 		 174 aa  141  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1852  hypothetical protein  49.35 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0886  transcription antitermination protein NusG  43.59 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  hitchhiker  0.00000687026 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2838  membrane protein  34.81 
 
 		 166 aa  105  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768899  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2966  hypothetical protein  35.12 
 
 		 236 aa  94  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280918  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4342  hypothetical protein  36.76 
 
 		 253 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.121402 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3478  hypothetical protein  23.93 
 
 		 419 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.300585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1781  protein of unknown function DUF989  31.9 
 
 		 438 aa  46.2  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.201182 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02521  predicted membrane protein  27.88 
 
 		 426 aa  45.8  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.216294  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1391  hypothetical protein  32.67 
 
 		 438 aa  45.8  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.196967  normal  0.0829452 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4624  hypothetical protein  29.41 
 
 		 412 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0455  hypothetical protein  29.41 
 
 		 411 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0353  hypothetical protein  32.67 
 
 		 414 aa  44.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3914  hypothetical protein  31.65 
 
 		 415 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2430  hypothetical protein  29.13 
 
 		 404 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4873  hypothetical protein  29.13 
 
 		 401 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2611  hypothetical protein  32.93 
 
 		 413 aa  42.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3294  hypothetical protein  28.92 
 
 		 407 aa  42.4  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.198313  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4495  hypothetical protein  32.58 
 
 		 410 aa  42  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122524  normal  0.0576102 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1345  protein of unknown function DUF989  29.76 
 
 		 397 aa  41.2  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>