31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1384 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1384  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  389  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0576  hypothetical protein  91.88 
 
 		 197 aa  348  3e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3039  hypothetical protein  62.38 
 
 		 204 aa  228  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1897  hypothetical protein  57.58 
 
 		 202 aa  209  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.169609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2734  hypothetical protein  58.82 
 
 		 190 aa  192  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2934  membrane-like protein  64.63 
 
 		 188 aa  185  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3105  hypothetical protein  52.55 
 
 		 204 aa  170  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.27509  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1398  hypothetical protein  59.21 
 
 		 190 aa  170  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259428  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1852  hypothetical protein  49.67 
 
 		 166 aa  139  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1372  hypothetical protein  47.2 
 
 		 174 aa  135  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0886  transcription antitermination protein NusG  42.95 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  hitchhiker  0.00000687026 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2838  membrane protein  37.18 
 
 		 166 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768899  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2966  hypothetical protein  35.71 
 
 		 236 aa  96.3  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280918  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4342  hypothetical protein  36.76 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.121402 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3478  hypothetical protein  37.35 
 
 		 419 aa  46.6  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.300585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0455  hypothetical protein  34.38 
 
 		 411 aa  45.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0353  hypothetical protein  37.8 
 
 		 414 aa  45.8  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1781  protein of unknown function DUF989  23.69 
 
 		 438 aa  45.1  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.201182 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3914  hypothetical protein  34.18 
 
 		 415 aa  44.7  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4624  hypothetical protein  30.15 
 
 		 412 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2611  hypothetical protein  35.37 
 
 		 413 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2430  hypothetical protein  29.13 
 
 		 404 aa  42.4  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3294  hypothetical protein  30.12 
 
 		 407 aa  42.4  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.198313  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3268  hypothetical protein  31.96 
 
 		 406 aa  42  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.152004 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4495  hypothetical protein  36.59 
 
 		 410 aa  42  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122524  normal  0.0576102 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3583  class I monoheme cytochrome c  31.96 
 
 		 406 aa  42  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.22446  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02521  predicted membrane protein  25.96 
 
 		 426 aa  42  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.216294  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4873  hypothetical protein  29.03 
 
 		 401 aa  42  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3207  protein of unknown function DUF989  34.15 
 
 		 410 aa  41.6  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.175006 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3325  hypothetical protein  23.83 
 
 		 410 aa  41.6  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1391  hypothetical protein  30.69 
 
 		 438 aa  41.6  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.196967  normal  0.0829452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>