24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1398 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1398  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  378  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259428  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2934  membrane-like protein  61.58 
 
 		 188 aa  208  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2734  hypothetical protein  60.1 
 
 		 190 aa  195  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0576  hypothetical protein  60.53 
 
 		 197 aa  188  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1384  hypothetical protein  51.32 
 
 		 197 aa  187  5.999999999999999e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3039  hypothetical protein  49.01 
 
 		 204 aa  177  8e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1897  hypothetical protein  45.45 
 
 		 202 aa  166  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.169609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3105  hypothetical protein  48.47 
 
 		 204 aa  159  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.27509  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1372  hypothetical protein  47.83 
 
 		 174 aa  128  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1852  hypothetical protein  47.4 
 
 		 166 aa  127  8.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0886  transcription antitermination protein NusG  41.36 
 
 		 212 aa  110  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  hitchhiker  0.00000687026 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2838  membrane protein  33.75 
 
 		 166 aa  94  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768899  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2966  hypothetical protein  37.97 
 
 		 236 aa  89  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280918  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4342  hypothetical protein  36.51 
 
 		 253 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.121402 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2761  hypothetical protein  33.33 
 
 		 430 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3615  hypothetical protein  32.32 
 
 		 442 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1369  hypothetical protein  28.87 
 
 		 251 aa  42.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1579  hypothetical protein  31.82 
 
 		 442 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3853  hypothetical protein  31.82 
 
 		 442 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0186652  normal  0.587321 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44880  hypothetical protein  32.88 
 
 		 425 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.798821  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4289  hypothetical protein  31.82 
 
 		 446 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3822  hypothetical protein  32.88 
 
 		 423 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115673  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4624  hypothetical protein  36.62 
 
 		 412 aa  41.2  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0835  protein of unknown function DUF989  32.84 
 
 		 398 aa  41.2  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.510797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>