23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3105 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3105  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  413  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.27509  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1897  hypothetical protein  53.66 
 
 
202 aa  202  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.169609  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3039  hypothetical protein  50.72 
 
 
204 aa  196  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1384  hypothetical protein  52.55 
 
 
197 aa  192  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0576  hypothetical protein  56.97 
 
 
197 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2734  hypothetical protein  50.5 
 
 
190 aa  171  6.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101284  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2934  membrane-like protein  60.51 
 
 
188 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1398  hypothetical protein  48.98 
 
 
190 aa  149  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259428  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1372  hypothetical protein  46.95 
 
 
174 aa  136  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1852  hypothetical protein  44.58 
 
 
166 aa  129  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0886  transcription antitermination protein NusG  41.67 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  hitchhiker  0.00000687026 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2966  hypothetical protein  37.79 
 
 
236 aa  94.7  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280918  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2838  membrane protein  31.18 
 
 
166 aa  92  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768899  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3478  hypothetical protein  25.45 
 
 
419 aa  49.7  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.300585  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4342  hypothetical protein  42.86 
 
 
253 aa  49.3  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.121402 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3914  hypothetical protein  23.21 
 
 
415 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410571  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2045  hypothetical protein  24.15 
 
 
394 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.654077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21090  hypothetical protein  22.07 
 
 
389 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0855882  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0353  hypothetical protein  25.43 
 
 
414 aa  44.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1391  hypothetical protein  25 
 
 
438 aa  43.5  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.196967  normal  0.0829452 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0455  hypothetical protein  25.11 
 
 
411 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4873  hypothetical protein  24.12 
 
 
401 aa  42.4  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4624  hypothetical protein  24.79 
 
 
412 aa  42  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.449143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>