18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2734 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2734  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  377  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2934  membrane-like protein  68.09 
 
 		 188 aa  215  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1384  hypothetical protein  58.82 
 
 		 197 aa  207  7e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0576  hypothetical protein  65.31 
 
 		 197 aa  205  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3039  hypothetical protein  57.29 
 
 		 204 aa  204  5e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1897  hypothetical protein  54.36 
 
 		 202 aa  190  8e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.169609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1398  hypothetical protein  60.1 
 
 		 190 aa  177  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259428  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3105  hypothetical protein  50.5 
 
 		 204 aa  170  9e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.27509  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1852  hypothetical protein  53.1 
 
 		 166 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1372  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  134  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0886  transcription antitermination protein NusG  41.89 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  hitchhiker  0.00000687026 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2966  hypothetical protein  41.45 
 
 		 236 aa  98.2  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280918  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2838  membrane protein  34.57 
 
 		 166 aa  88.6  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768899  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4342  hypothetical protein  41.27 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.121402 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0835  protein of unknown function DUF989  23.14 
 
 		 398 aa  45.4  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.510797  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21090  hypothetical protein  30 
 
 		 389 aa  43.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0855882  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1391  hypothetical protein  36.07 
 
 		 438 aa  42.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.196967  normal  0.0829452 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1781  protein of unknown function DUF989  36.07 
 
 		 438 aa  41.2  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.201182 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>