16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2838 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2838  membrane protein  100 
 
 
166 aa  332  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768899  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1852  hypothetical protein  44.79 
 
 
166 aa  123  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1384  hypothetical protein  37.18 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1372  hypothetical protein  39.77 
 
 
174 aa  108  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0576  hypothetical protein  34.81 
 
 
197 aa  105  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3039  hypothetical protein  35.8 
 
 
204 aa  97.4  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1897  hypothetical protein  36.31 
 
 
202 aa  92  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.169609  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2934  membrane-like protein  35.62 
 
 
188 aa  86.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1398  hypothetical protein  33.75 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259428  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3105  hypothetical protein  31.18 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.27509  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2734  hypothetical protein  34.57 
 
 
190 aa  80.5  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101284  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2966  hypothetical protein  30.25 
 
 
236 aa  73.9  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280918  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0886  transcription antitermination protein NusG  33.54 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  hitchhiker  0.00000687026 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4342  hypothetical protein  27.68 
 
 
253 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.121402 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0835  protein of unknown function DUF989  31.11 
 
 
398 aa  42  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.510797  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3914  hypothetical protein  34.78 
 
 
415 aa  40.4  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410571  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>