More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1381 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  100 
 
 
312 aa  613  9.999999999999999e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  62.34 
 
 
312 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  57.19 
 
 
307 aa  345  4e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  57.14 
 
 
308 aa  345  5e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  56.96 
 
 
308 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  60.84 
 
 
309 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  56.31 
 
 
308 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  57.68 
 
 
307 aa  335  3.9999999999999995e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  56.86 
 
 
307 aa  335  7e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  56.73 
 
 
308 aa  331  8e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  56.73 
 
 
308 aa  329  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  57.37 
 
 
308 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  56.91 
 
 
307 aa  328  6e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3195  translation elongation factor Ts  57.28 
 
 
308 aa  323  3e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  56.59 
 
 
307 aa  322  8e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  55.37 
 
 
310 aa  320  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  55.26 
 
 
300 aa  318  5e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  56.04 
 
 
305 aa  318  7.999999999999999e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  56.04 
 
 
305 aa  318  7.999999999999999e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  55.08 
 
 
303 aa  318  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  55.81 
 
 
301 aa  315  8e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  54.81 
 
 
308 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2034  elongation factor Ts  58.06 
 
 
306 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0653103 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  53.9 
 
 
307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  54.79 
 
 
296 aa  302  5.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  54.93 
 
 
310 aa  301  9e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1697  elongation factor Ts  56.77 
 
 
307 aa  299  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2074  elongation factor Ts  57.42 
 
 
306 aa  298  5e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0812187  normal  0.288352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2348  elongation factor Ts  57.42 
 
 
306 aa  298  5e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.474929 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3449  elongation factor Ts  54.95 
 
 
308 aa  296  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190771  normal  0.488523 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  56.86 
 
 
291 aa  293  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4828  elongation factor Ts  55.34 
 
 
307 aa  290  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0383674  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1695  elongation factor Ts  54.39 
 
 
301 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  57.43 
 
 
291 aa  281  9e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1959  elongation factor Ts  54.3 
 
 
308 aa  280  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  53.8 
 
 
291 aa  276  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4438  elongation factor Ts  55.59 
 
 
307 aa  276  4e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000816473 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2224  elongation factor Ts  52.3 
 
 
310 aa  271  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1370  elongation factor Ts  51.68 
 
 
308 aa  265  5e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  49.51 
 
 
303 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  44.95 
 
 
311 aa  245  8e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  47.87 
 
 
289 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0515  elongation factor Ts  44.4 
 
 
288 aa  242  5e-63  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  45.31 
 
 
294 aa  239  4e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0516  elongation factor Ts  43.17 
 
 
288 aa  238  1e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.203151  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1511  elongation factor Ts  53.85 
 
 
298 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501204  normal  0.0222785 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  48.68 
 
 
295 aa  232  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  49.35 
 
 
294 aa  232  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  47.27 
 
 
303 aa  232  6e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  49.34 
 
 
295 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  48.68 
 
 
295 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  48.68 
 
 
295 aa  231  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  48.68 
 
 
295 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  48.68 
 
 
295 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  48.68 
 
 
295 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  49.34 
 
 
295 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  47.27 
 
 
303 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2861  elongation factor Ts  51.28 
 
 
298 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1432  elongation factor Ts  51.28 
 
 
298 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  hitchhiker  0.00915816 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  48.36 
 
 
295 aa  229  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  48.36 
 
 
295 aa  229  5e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  48.36 
 
 
294 aa  228  9e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  45.25 
 
 
310 aa  228  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  44.22 
 
 
292 aa  227  2e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  45.75 
 
 
294 aa  226  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  48.03 
 
 
295 aa  226  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  45.19 
 
 
283 aa  225  6e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  45.78 
 
 
293 aa  225  8e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  46.67 
 
 
285 aa  225  9e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  43.9 
 
 
294 aa  224  1e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  43.38 
 
 
292 aa  223  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_002978  WD0531  elongation factor Ts  42.96 
 
 
286 aa  223  4e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  46.67 
 
 
285 aa  222  7e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  43.58 
 
 
288 aa  221  9e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  46.25 
 
 
293 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  43.46 
 
 
292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  46.01 
 
 
283 aa  219  5e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  46.01 
 
 
283 aa  219  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  46.01 
 
 
283 aa  219  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  46.01 
 
 
283 aa  219  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  46.01 
 
 
283 aa  219  5e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  46.01 
 
 
283 aa  219  5e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  46.01 
 
 
283 aa  219  5e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  46.01 
 
 
283 aa  219  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  46.01 
 
 
283 aa  219  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1261  elongation factor Ts  40.83 
 
 
354 aa  218  1e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00427037  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  45.05 
 
 
283 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  46.41 
 
 
291 aa  217  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  44.55 
 
 
292 aa  217  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  42.99 
 
 
313 aa  217  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  47.25 
 
 
292 aa  217  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  44.44 
 
 
290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  46.58 
 
 
293 aa  216  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  46.58 
 
 
293 aa  216  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  41.78 
 
 
286 aa  216  5e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  45.13 
 
 
292 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  46.05 
 
 
292 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0550  elongation factor Ts  39.72 
 
 
348 aa  215  9.999999999999999e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00242368  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  44.73 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  45.37 
 
 
283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>