More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0001 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 		 482 aa  983    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000460391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.35 
 
 		 519 aa  355  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  unclonable  1.2245600000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0001  chromosomal replication initiation protein  41.49 
 
 		 473 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0001  chromosomal replication initiation protein  41.28 
 
 		 475 aa  352  1e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0001  chromosomal replication initiation protein  39.83 
 
 		 472 aa  346  6e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0001  chromosomal replication initiation protein  40.43 
 
 		 472 aa  346  6e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583954  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0001  chromosomal replication initiation protein  41.45 
 
 		 472 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0001  chromosomal replication initiation protein  39.75 
 
 		 475 aa  344  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0001  chromosomal replication initiation protein  39.96 
 
 		 494 aa  342  7e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.852723  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0001  chromosomal replication initiation protein  41.79 
 
 		 475 aa  342  7e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0001  chromosomal replication initiation protein  40.78 
 
 		 509 aa  342  1e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0002  chromosomal replication initiation protein  40.7 
 
 		 501 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0001  chromosomal replication initiation protein  40.04 
 
 		 501 aa  335  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0002  chromosomal replication initiation protein  40.04 
 
 		 501 aa  335  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.536334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0002  chromosomal replication initiation protein  40.21 
 
 		 498 aa  334  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0001  chromosomal replication initiation protein  38.56 
 
 		 460 aa  334  3e-90  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.335135  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0001  chromosomal replication initiation protein  39.91 
 
 		 482 aa  331  2e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0001  chromosomal replication initiation protein  38.61 
 
 		 506 aa  330  4e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0001  chromosomal replication initiation protein  40.73 
 
 		 487 aa  330  5.0000000000000004e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.775334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0001  chromosomal replication initiation protein  39.58 
 
 		 499 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00640124  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0270  chromosomal replication initiation protein  37.47 
 
 		 452 aa  327  3e-88  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.43885  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0001  chromosomal replication initiation protein  38.06 
 
 		 506 aa  327  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0129481  hitchhiker  0.0000000143408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0001  chromosomal replication initiation protein  37.89 
 
 		 479 aa  324  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0301114  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0809  chromosomal replication initiation protein  37.61 
 
 		 464 aa  323  4e-87  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54082  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0003  chromosomal replication initiation protein  39.09 
 
 		 510 aa  319  7.999999999999999e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000244231  normal  0.247706 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2833  chromosomal replication initiation protein  37.14 
 
 		 448 aa  317  4e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0001  chromosomal replication initiation protein  38.77 
 
 		 477 aa  316  5e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.839498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3373  chromosomal replication initiation protein  36.83 
 
 		 460 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0002  chromosomal replication initiation protein  38.11 
 
 		 461 aa  310  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.020385  hitchhiker  0.000000603983 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0001  chromosomal replication initiation protein  35.76 
 
 		 470 aa  305  8.000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0703594  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.21 
 
 		 477 aa  303  5.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0001  chromosomal replication initiation protein  37.03 
 
 		 516 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0192779 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0391  chromosomal replication initiation protein  35.31 
 
 		 524 aa  302  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246214  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1342  chromosomal replication initiation protein  38.51 
 
 		 455 aa  302  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0011  chromosomal replication initiation protein  38.51 
 
 		 455 aa  302  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0001  chromosomal replication initiation protein  35.49 
 
 		 516 aa  299  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.962631  hitchhiker  0.00495499 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1279  chromosomal replication initiation protein  36.19 
 
 		 524 aa  296  5e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000504678  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  36.62 
 
 		 449 aa  293  5e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  34.93 
 
 		 451 aa  293  7e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  34.93 
 
 		 451 aa  293  7e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0003  chromosomal replication initiation protein  36.76 
 
 		 520 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.0000273847  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0001  chromosomal replication initiation protein  35.51 
 
 		 496 aa  290  3e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00276825  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  36.89 
 
 		 472 aa  290  5.0000000000000004e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0002  chromosomal replication initiation protein  36.97 
 
 		 481 aa  290  6e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480088  hitchhiker  0.0000132312 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0001  chromosomal replication initiation protein  35.51 
 
 		 496 aa  290  6e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000869739  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  34.2 
 
 		 452 aa  289  8e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  35.02 
 
 		 452 aa  287  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  35.02 
 
 		 452 aa  287  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0259  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.48 
 
 		 474 aa  287  2.9999999999999996e-76  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  33.69 
 
 		 460 aa  282  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.16 
 
 		 474 aa  281  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00208216  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  35.02 
 
 		 461 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  33.69 
 
 		 460 aa  281  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  33.47 
 
 		 460 aa  281  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  33.47 
 
 		 460 aa  280  4e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  35.05 
 
 		 455 aa  280  5e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  34.48 
 
 		 463 aa  280  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  34.86 
 
 		 467 aa  279  7e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.86 
 
 		 467 aa  279  7e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  34.86 
 
 		 467 aa  279  7e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  36.73 
 
 		 468 aa  279  7e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  34.86 
 
 		 467 aa  279  7e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  34.86 
 
 		 467 aa  279  7e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  34.86 
 
 		 467 aa  279  7e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  34.86 
 
 		 467 aa  278  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.02 
 
 		 462 aa  278  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0001  chromosomal replication initiation protein  36.17 
 
 		 498 aa  279  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  35.07 
 
 		 467 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  33.97 
 
 		 459 aa  278  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  36.65 
 
 		 468 aa  278  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  35.7 
 
 		 462 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  35.7 
 
 		 462 aa  278  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3033  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.95 
 
 		 442 aa  277  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.949168  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  34.19 
 
 		 462 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  34.19 
 
 		 462 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  34.19 
 
 		 462 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  34.19 
 
 		 462 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  35.26 
 
 		 467 aa  276  5e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  35.47 
 
 		 465 aa  276  7e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  34.56 
 
 		 462 aa  276  7e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  35.36 
 
 		 466 aa  276  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  35.36 
 
 		 466 aa  276  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  35.36 
 
 		 466 aa  276  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  35.36 
 
 		 466 aa  276  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.47 
 
 		 463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  35.28 
 
 		 466 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.15 
 
 		 483 aa  275  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.84 
 
 		 464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  34.59 
 
 		 465 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  33.62 
 
 		 461 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  33.91 
 
 		 462 aa  274  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  30.37 
 
 		 453 aa  273  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  33.97 
 
 		 462 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  30.37 
 
 		 453 aa  273  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  33.83 
 
 		 461 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  36.03 
 
 		 451 aa  273  5.000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0001  chromosomal replication initiation protein  34.18 
 
 		 475 aa  272  9e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  32.89 
 
 		 446 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  31.24 
 
 		 451 aa  271  2e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0001  chromosomal replication initiation protein  33.47 
 
 		 495 aa  271  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>