128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0083 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0083  50S ribosomal protein L23P  100 
 
 		 82 aa  159  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.657611  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0534  50S ribosomal protein L23P  56.79 
 
 		 83 aa  96.3  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.646212  normal  0.481774 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0444  50S ribosomal protein L23P  53.66 
 
 		 82 aa  96.3  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0443463  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0566  50S ribosomal protein L23P  51.22 
 
 		 82 aa  89.7  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0431079  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2251  50S ribosomal protein L23P  46.34 
 
 		 82 aa  83.6  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000000299035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0108  50S ribosomal protein L23P  44.44 
 
 		 82 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2220  ribosomal protein L23  41.77 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0212  ribosomal protein L23  40.51 
 
 		 84 aa  69.7  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0003  50S ribosomal protein L23P  41.25 
 
 		 82 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000337619  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0793  50S ribosomal protein L23P  46.05 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.110307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0031  50S ribosomal protein L23P  46.05 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2294  50S ribosomal protein L23P  40.51 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1125  50S ribosomal protein L23P  46.05 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2447  50S ribosomal protein L23P  35.44 
 
 		 84 aa  67  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0228  ribosomal protein L25/L23  36.25 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0859  50S ribosomal protein L23P  42.11 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.455359  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1519  ribosomal protein L23  39.47 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000262554  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0093  50S ribosomal protein L23P  41.89 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000249681  unclonable  0.000000335999 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0805  50S ribosomal protein L23P  38.16 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.720418  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1726  ribosomal protein L25/L23  34.15 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1830  50S ribosomal protein L23P  34.18 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.649517 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16602  Ribosomal protein L23a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  30 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1585  50S ribosomal protein L23P  34.21 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0815  50S ribosomal protein L23P  35.53 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00350  ribosomal protein, putative  35.8 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0315  ribosomal protein L25/L23  35.53 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.997937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0807  50S ribosomal protein L25/L23  33.77 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.563432 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2048  50S ribosomal protein L23P  32.93 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.700766 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1798  50S ribosomal protein L23P  31.58 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.217622  normal  0.590833 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0604  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0267  50S ribosomal protein L23  34.83 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000129072  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1776  ribosomal protein L23  40 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0291  50S ribosomal protein L23  38.55 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2230  50S ribosomal protein L23  40.68 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  40.68 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08856  60S ribosomal protein L23 (AFU_orthologue; AFUA_5G05630)  44.83 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  45.9 
 
 		 94 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  31.82 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  42.11 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  37.5 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1944  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  31.17 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  40.68 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  40.68 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  40.68 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61259  predicted protein  31.17 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  37.97 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  37.97 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  40.68 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  40.68 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2816  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.439693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0395  50S ribosomal protein L23  45.1 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  38.98 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04000  50S ribosomal protein L23  31.03 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  41.07 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2561  Ribosomal protein L25/L23  40 
 
 		 104 aa  45.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  36.23 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6612  50S ribosomal protein L23  45.1 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1849  50S ribosomal protein L23  41.18 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.310449  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  38.98 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  41.07 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  41.07 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  40.62 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  37.14 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2063  50S ribosomal protein L23  44.9 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000000993724  normal  0.203735 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2227  50S ribosomal protein L23  34.94 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000627291  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2294  50S ribosomal protein L23  34.94 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0336822  normal  0.0105282 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  41.07 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  35.16 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  36.07 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  41.07 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  36.84 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0693  50S ribosomal protein L23  33.9 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.001904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  39.29 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  37.25 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3010  50S ribosomal protein L23  31.03 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00732369 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  39.29 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  39.29 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  42.62 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00732  50S ribosomal protein L23  40.68 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001740  LSU ribosomal protein L23p (L23Ae)  40.68 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000423409  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  41.38 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  46.43 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  44.68 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  44.07 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2968  50S ribosomal protein L23  46.43 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.307651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0662  50S ribosomal protein L23  36.21 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000319643  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0194  Ribosomal protein L25/L23  36.99 
 
 		 94 aa  42  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3993  Ribosomal protein L25/L23  33.9 
 
 		 94 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1187  Ribosomal protein L25/L23  43.75 
 
 		 104 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.102596 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  35.82 
 
 		 93 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  35.44 
 
 		 94 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000134151  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0578  Ribosomal protein L25/L23  42.86 
 
 		 102 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  38.24 
 
 		 97 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  32.91 
 
 		 100 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  35.44 
 
 		 94 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  34.18 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0758  50S ribosomal protein L23  43.1 
 
 		 99 aa  41.2  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156644  normal  0.0173378 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>