154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1726 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1726  ribosomal protein L25/L23  100 
 
 		 82 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0566  50S ribosomal protein L23P  47.56 
 
 		 82 aa  84.3  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0431079  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2447  50S ribosomal protein L23P  46.91 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0228  ribosomal protein L25/L23  46.91 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2251  50S ribosomal protein L23P  42.68 
 
 		 82 aa  79.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000000299035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0444  50S ribosomal protein L23P  40.24 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0443463  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0212  ribosomal protein L23  44.44 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2220  ribosomal protein L23  43.21 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1830  50S ribosomal protein L23P  45.68 
 
 		 85 aa  73.9  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.649517 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0805  50S ribosomal protein L23P  41.25 
 
 		 86 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.720418  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0031  50S ribosomal protein L23P  42.5 
 
 		 86 aa  72  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0793  50S ribosomal protein L23P  42.5 
 
 		 86 aa  72  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.110307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1125  50S ribosomal protein L23P  42.5 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0534  50S ribosomal protein L23P  38.75 
 
 		 83 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.646212  normal  0.481774 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1798  50S ribosomal protein L23P  45.68 
 
 		 81 aa  70.5  0.000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.217622  normal  0.590833 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0108  50S ribosomal protein L23P  42.5 
 
 		 82 aa  69.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1585  50S ribosomal protein L23P  45.68 
 
 		 81 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0859  50S ribosomal protein L23P  40 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.455359  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2048  50S ribosomal protein L23P  46.34 
 
 		 82 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.700766 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16602  Ribosomal protein L23a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  40.24 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00350  ribosomal protein, putative  42.5 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1519  ribosomal protein L23  45.12 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000262554  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2294  50S ribosomal protein L23P  38.27 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0093  50S ribosomal protein L23P  40.74 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000249681  unclonable  0.000000335999 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0315  ribosomal protein L25/L23  46.58 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.997937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0003  50S ribosomal protein L23P  37.5 
 
 		 82 aa  60.8  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000337619  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61259  predicted protein  37.04 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08856  60S ribosomal protein L23 (AFU_orthologue; AFUA_5G05630)  43.9 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0815  50S ribosomal protein L23P  40.74 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0083  50S ribosomal protein L23P  34.15 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.657611  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0807  50S ribosomal protein L25/L23  38.27 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.563432 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  45.78 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  44.58 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  41.43 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  44.58 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  44.58 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1776  ribosomal protein L23  40.74 
 
 		 81 aa  53.5  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2230  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  40.96 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0215  50S ribosomal protein L23  37.88 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000957762  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  43.04 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  43.04 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  41.43 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0325  50S ribosomal protein L23  41.51 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000118373  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  41.77 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  41.77 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0407  50S ribosomal protein L23  41.51 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00180319  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  40.96 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001740  LSU ribosomal protein L23p (L23Ae)  39.06 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000423409  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00732  50S ribosomal protein L23  39.06 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0061  50S ribosomal protein L23  41.51 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000105028  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0322  50S ribosomal protein L23  37.5 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00637694  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  45 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  45 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0195  50S ribosomal protein L23  51.92 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  45.31 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4688  50S ribosomal protein L23  34.85 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000001343  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0201  50S ribosomal protein L23  35.71 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000118285  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0233  50S ribosomal protein L23  38.89 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1617  Ribosomal protein L25/L23  38.24 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 		 98 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0201  50S ribosomal protein L23  38.89 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000698801  unclonable  0.0000000000184888 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0196  50S ribosomal protein L23  38.89 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000848979  decreased coverage  0.000284829 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0460  50S ribosomal protein L23P  33.33 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0150  50S ribosomal protein L23  39.62 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125205  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2172  50S ribosomal protein L23  41.51 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267938  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4315  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000209174  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0693  50S ribosomal protein L23  40.58 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.001904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0172  50S ribosomal protein L23  39.62 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243767  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4054  50S ribosomal protein L23  38.89 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000001282  unclonable  0.00000000000566696 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  38.81 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3010  50S ribosomal protein L23  42.62 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00732369 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0285  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000248684  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0586  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108369  normal  0.186609 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  40.3 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4168  50S ribosomal protein L23  38.89 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000463544  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3757  50S ribosomal protein L23  38.89 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0198  50S ribosomal protein L23  38.89 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000795974  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3913  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.78804e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0186  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000102577  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0202  50S ribosomal protein L23  38.89 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000251497  unclonable  0.00000770372 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2816  50S ribosomal protein L23  37.97 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.439693 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  40.58 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0849  50S ribosomal protein L23P  38.46 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000828313  decreased coverage  0.0000112275 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1913  50S ribosomal protein L23  36.23 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.263974 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4542  50S ribosomal protein L23  37.74 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000172317  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  36.23 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  39.29 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  36.23 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0289  50S ribosomal protein L23  36 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0312226  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  36.23 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3160  50S ribosomal protein L23  41.67 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0604  Ribosomal protein L25/L23  35.85 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  37.35 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  38.81 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3522  ribosomal protein L25/L23  38.46 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000457129  hitchhiker  0.00000622944 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3820  50S ribosomal protein L23  37.74 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000460172  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  42.62 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  36.14 
 
 		 98 aa  42.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>