106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_16602 on replicon NC_009362
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009362  OSTLU_16602  Ribosomal protein L23a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  100 
 
 		 121 aa  246  7e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00350  ribosomal protein, putative  56.41 
 
 		 154 aa  140  5e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08856  60S ribosomal protein L23 (AFU_orthologue; AFUA_5G05630)  57.66 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61259  predicted protein  54.62 
 
 		 139 aa  133  9.999999999999999e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0228  ribosomal protein L25/L23  47.67 
 
 		 90 aa  88.2  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0805  50S ribosomal protein L23P  42.35 
 
 		 86 aa  83.6  9e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.720418  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0859  50S ribosomal protein L23P  43.53 
 
 		 86 aa  80.9  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.455359  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2447  50S ribosomal protein L23P  39.51 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0793  50S ribosomal protein L23P  40 
 
 		 86 aa  73.6  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.110307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0031  50S ribosomal protein L23P  40 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1125  50S ribosomal protein L23P  40 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0093  50S ribosomal protein L23P  38.27 
 
 		 81 aa  71.6  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000249681  unclonable  0.000000335999 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2048  50S ribosomal protein L23P  39.51 
 
 		 82 aa  70.1  0.000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.700766 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1798  50S ribosomal protein L23P  39.51 
 
 		 81 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.217622  normal  0.590833 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1585  50S ribosomal protein L23P  38.27 
 
 		 81 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0815  50S ribosomal protein L23P  40.74 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1830  50S ribosomal protein L23P  38.55 
 
 		 85 aa  68.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.649517 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1726  ribosomal protein L25/L23  40.24 
 
 		 82 aa  68.2  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2220  ribosomal protein L23  39.51 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2294  50S ribosomal protein L23P  38.82 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1776  ribosomal protein L23  40.74 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2251  50S ribosomal protein L23P  38.27 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000000299035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0212  ribosomal protein L23  35.8 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0444  50S ribosomal protein L23P  35.8 
 
 		 82 aa  60.8  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0443463  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0534  50S ribosomal protein L23P  33.75 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.646212  normal  0.481774 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1519  ribosomal protein L23  38.96 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000262554  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0083  50S ribosomal protein L23P  30 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.657611  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0108  50S ribosomal protein L23P  33.75 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0566  50S ribosomal protein L23P  32.1 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0431079  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0315  ribosomal protein L25/L23  33.33 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.997937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0604  Ribosomal protein L25/L23  41.27 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0003  50S ribosomal protein L23P  33.75 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000337619  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0322  50S ribosomal protein L23  36.36 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00637694  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  40.74 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2255  50S ribosomal protein L23  34.25 
 
 		 96 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000014312  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  42.31 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2172  50S ribosomal protein L23  32.94 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267938  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0807  50S ribosomal protein L25/L23  31.71 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.563432 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  34.29 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3160  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00732  50S ribosomal protein L23  32.94 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3993  Ribosomal protein L25/L23  37.04 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001740  LSU ribosomal protein L23p (L23Ae)  32.94 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000423409  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  35.94 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1228  50S ribosomal protein L23  35.8 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.195733  unclonable  0.00000945894 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2905  50S ribosomal protein L23  38.46 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000254231  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3913  50S ribosomal protein L23  34.85 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.78804e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0586  50S ribosomal protein L23  34.85 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108369  normal  0.186609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0285  50S ribosomal protein L23  34.85 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000248684  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  36.49 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  34.67 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0194  Ribosomal protein L25/L23  37.04 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0289  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0312226  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  35.94 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  38.46 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  35.94 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  35.94 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  35.09 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  38.89 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  33.78 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0081  50S ribosomal protein L23  35.94 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  27.17 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0871  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3522  ribosomal protein L25/L23  30 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000457129  hitchhiker  0.00000622944 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3749  50S ribosomal protein L23  37.04 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000048697  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0428  50S ribosomal protein L23  36.05 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291057  decreased coverage  0.00000564548 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4542  50S ribosomal protein L23  37.04 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000172317  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  39.06 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  35.82 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  39.06 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1718  50S ribosomal protein L23  28.57 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0786377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  35.09 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  35.94 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0363  50S ribosomal protein L23  28.57 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.674139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1136  ribosomal protein L25/L23  37.74 
 
 		 100 aa  42  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000719358  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1681  50S ribosomal protein L23  37.5 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0570438  hitchhiker  0.0000115816 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0395  50S ribosomal protein L23  37.29 
 
 		 96 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0195  50S ribosomal protein L23  37.7 
 
 		 95 aa  42  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  41.38 
 
 		 103 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03169  50S ribosomal protein L23  35.19 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000759178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0395  Ribosomal protein L25/L23  35.19 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000225919  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3512  50S ribosomal protein L23  35.19 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000392959  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3801  50S ribosomal protein L23  35.19 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000749996  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0395  50S ribosomal protein L23  35.19 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000080861  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3613  50S ribosomal protein L23  35.19 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000847098  hitchhiker  0.00309782 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3703  50S ribosomal protein L23  35.19 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4641  50S ribosomal protein L23  35.19 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287124  normal  0.0460173 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0407  50S ribosomal protein L23  37.04 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00180319  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03120  hypothetical protein  35.19 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000565358  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0933  Ribosomal protein L25/L23  37.04 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  35.48 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3707  50S ribosomal protein L23  35.19 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000802937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3742  50S ribosomal protein L23  35.19 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.344368  normal  0.0150111 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3634  50S ribosomal protein L23  35.19 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00980054  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3634  50S ribosomal protein L23  35.19 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000793915  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3805  50S ribosomal protein L23  35.19 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000686351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0578  Ribosomal protein L25/L23  33.33 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  28.26 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0325  50S ribosomal protein L23  37.04 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000118373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>