97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0566 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0566  50S ribosomal protein L23P  100 
 
 		 82 aa  164  5e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0431079  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0534  50S ribosomal protein L23P  73.75 
 
 		 83 aa  124  6e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.646212  normal  0.481774 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0444  50S ribosomal protein L23P  67.07 
 
 		 82 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0443463  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2251  50S ribosomal protein L23P  59.76 
 
 		 82 aa  102  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000000299035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0083  50S ribosomal protein L23P  51.22 
 
 		 82 aa  89.7  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.657611  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1726  ribosomal protein L25/L23  47.56 
 
 		 82 aa  84.3  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0212  ribosomal protein L23  48.75 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0108  50S ribosomal protein L23P  51.25 
 
 		 82 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2220  ribosomal protein L23  46.25 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2294  50S ribosomal protein L23P  47.5 
 
 		 87 aa  77  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0003  50S ribosomal protein L23P  46.25 
 
 		 82 aa  72  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000337619  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1519  ribosomal protein L23  48.05 
 
 		 87 aa  70.1  0.000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000262554  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2447  50S ribosomal protein L23P  41.25 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0859  50S ribosomal protein L23P  43.21 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.455359  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0793  50S ribosomal protein L23P  40.74 
 
 		 86 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.110307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0031  50S ribosomal protein L23P  40.74 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1125  50S ribosomal protein L23P  40.74 
 
 		 86 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0805  50S ribosomal protein L23P  37.5 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.720418  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2048  50S ribosomal protein L23P  40.24 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.700766 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1830  50S ribosomal protein L23P  38.75 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.649517 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0807  50S ribosomal protein L25/L23  39.02 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.563432 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0228  ribosomal protein L25/L23  38.27 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1585  50S ribosomal protein L23P  38.27 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0315  ribosomal protein L25/L23  39.51 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.997937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1798  50S ribosomal protein L23P  38.27 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.217622  normal  0.590833 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0093  50S ribosomal protein L23P  39.51 
 
 		 81 aa  57  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000249681  unclonable  0.000000335999 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0815  50S ribosomal protein L23P  39.51 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16602  Ribosomal protein L23a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  32.1 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001740  LSU ribosomal protein L23p (L23Ae)  45 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000423409  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0322  50S ribosomal protein L23  45 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00637694  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00732  50S ribosomal protein L23  45 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4274  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000576147  unclonable  0.00000000000382148 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2172  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267938  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1776  ribosomal protein L23  39.19 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0703  50S ribosomal protein L23  39.29 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000032639  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06270  50S ribosomal protein L23  39.68 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219554  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  43.55 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2227  50S ribosomal protein L23  33.72 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000627291  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1348  50S ribosomal protein L23  40.38 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0302  Ribosomal protein L25/L23  47.06 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.055916  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00350  ribosomal protein, putative  32.5 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0215  50S ribosomal protein L23  44.64 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000957762  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0856  50S ribosomal protein L23  36.67 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483725  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0499  50S ribosomal protein L23  36.07 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.173851  hitchhiker  0.00000000336824 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0329  50S ribosomal protein L23  36.07 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0839  50S ribosomal protein L23  41.67 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0291  50S ribosomal protein L23  38.89 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2322  50S ribosomal protein L23  38.46 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000334931  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08870  50S ribosomal protein L23  41.67 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.679116  hitchhiker  0.00894178 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  41.43 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  39.13 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  38.27 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  41.33 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  36.36 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0325  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000118373  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  38.27 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0407  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 100 aa  42.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00180319  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0682  50S ribosomal protein L23  38.46 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0471  50S ribosomal protein L23  44.64 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000395002  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0285  50S ribosomal protein L23  38.33 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000248684  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  37.1 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1913  50S ribosomal protein L23  37.1 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.263974 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  37.1 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3913  50S ribosomal protein L23  38.33 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.78804e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2294  50S ribosomal protein L23  40.74 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0336822  normal  0.0105282 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4315  50S ribosomal protein L23  34.15 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000209174  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  37.1 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0586  50S ribosomal protein L23  38.33 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108369  normal  0.186609 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0393  50S ribosomal protein L23  41.67 
 
 		 104 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000842978  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0456  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 99 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0420406  unclonable  0.000000164588 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0486  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 99 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00438289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0489  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 99 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000019112  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4747  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 99 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000334762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2421  50S ribosomal protein L23  37.8 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00215934  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  40.38 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0055  50S ribosomal protein L23  36.92 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233404  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4688  50S ribosomal protein L23  38.33 
 
 		 99 aa  41.2  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000001343  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0052  50S ribosomal protein L23  36.92 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000136053  hitchhiker  3.59649e-24 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  32.58 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  34.88 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  42.31 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  34.88 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  44.26 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4911  50S ribosomal protein L23  41.67 
 
 		 111 aa  41.2  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000771327  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  40.91 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0423  50S ribosomal protein L23P  35.63 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0123777  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  38.33 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  41.94 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  41.94 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0150  50S ribosomal protein L23  38.33 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125205  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2255  50S ribosomal protein L23  35.37 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000014312  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  37.1 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0160  50S ribosomal protein L23  39.29 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000144621  decreased coverage  0.0000412321 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1069  50S ribosomal protein L23  34.62 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000947106  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0496  50S ribosomal protein L23  36.07 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000003402  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0081  50S ribosomal protein L23  33.72 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158855 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>