44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0093 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0093  50S ribosomal protein L23P  100 
 
 		 81 aa  157  7e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000249681  unclonable  0.000000335999 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1776  ribosomal protein L23  65.43 
 
 		 81 aa  93.2  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1798  50S ribosomal protein L23P  53.09 
 
 		 81 aa  88.2  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.217622  normal  0.590833 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1585  50S ribosomal protein L23P  53.09 
 
 		 81 aa  85.5  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0815  50S ribosomal protein L23P  54.32 
 
 		 81 aa  83.6  9e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0228  ribosomal protein L25/L23  54.05 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2048  50S ribosomal protein L23P  48.15 
 
 		 82 aa  79.7  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.700766 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0805  50S ribosomal protein L23P  45 
 
 		 86 aa  74.3  0.0000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.720418  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0859  50S ribosomal protein L23P  46.25 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.455359  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0793  50S ribosomal protein L23P  43.75 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.110307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0031  50S ribosomal protein L23P  43.75 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16602  Ribosomal protein L23a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  38.27 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00350  ribosomal protein, putative  42.5 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1125  50S ribosomal protein L23P  43.75 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0315  ribosomal protein L25/L23  50.62 
 
 		 86 aa  70.5  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.997937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1726  ribosomal protein L25/L23  40.74 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0444  50S ribosomal protein L23P  41.98 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0443463  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0083  50S ribosomal protein L23P  41.89 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.657611  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0534  50S ribosomal protein L23P  42.5 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.646212  normal  0.481774 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1519  ribosomal protein L23  43.24 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000262554  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08856  60S ribosomal protein L23 (AFU_orthologue; AFUA_5G05630)  41.56 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0566  50S ribosomal protein L23P  39.51 
 
 		 82 aa  57  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0431079  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61259  predicted protein  37.04 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0212  ribosomal protein L23  37.04 
 
 		 84 aa  57  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2447  50S ribosomal protein L23P  34.57 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2220  ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2251  50S ribosomal protein L23P  37.04 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000000299035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0108  50S ribosomal protein L23P  39.19 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2063  50S ribosomal protein L23  37.8 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000000993724  normal  0.203735 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2294  50S ribosomal protein L23P  35.14 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1830  50S ribosomal protein L23P  34.57 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.649517 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0003  50S ribosomal protein L23P  35 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000337619  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  39.02 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0267  50S ribosomal protein L23  47.37 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000129072  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0758  50S ribosomal protein L23  43.06 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156644  normal  0.0173378 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0194  Ribosomal protein L25/L23  43.06 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  37.04 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  37.04 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1136  ribosomal protein L25/L23  41.18 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000719358  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  46.67 
 
 		 96 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3010  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 		 101 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00732369 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  51.11 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  39.29 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  47.17 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>