191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_61259 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_61259  predicted protein  100 
 
 		 139 aa  277  4e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08856  60S ribosomal protein L23 (AFU_orthologue; AFUA_5G05630)  64.89 
 
 		 153 aa  170  5.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00350  ribosomal protein, putative  61.11 
 
 		 154 aa  157  5e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16602  Ribosomal protein L23a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  54.62 
 
 		 121 aa  133  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0228  ribosomal protein L25/L23  51.16 
 
 		 90 aa  83.6  9e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0805  50S ribosomal protein L23P  52.38 
 
 		 86 aa  83.6  9e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.720418  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0031  50S ribosomal protein L23P  48.81 
 
 		 86 aa  80.1  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1125  50S ribosomal protein L23P  48.81 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0793  50S ribosomal protein L23P  47.62 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.110307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0859  50S ribosomal protein L23P  48.81 
 
 		 86 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.455359  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2447  50S ribosomal protein L23P  44.3 
 
 		 84 aa  69.7  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2294  50S ribosomal protein L23P  43.37 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1726  ribosomal protein L25/L23  37.04 
 
 		 82 aa  60.5  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0212  ribosomal protein L23  41.77 
 
 		 84 aa  58.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0093  50S ribosomal protein L23P  37.04 
 
 		 81 aa  57  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000249681  unclonable  0.000000335999 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1798  50S ribosomal protein L23P  38.16 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.217622  normal  0.590833 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2220  ribosomal protein L23  37.97 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1830  50S ribosomal protein L23P  39.51 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.649517 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1585  50S ribosomal protein L23P  39.47 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2048  50S ribosomal protein L23P  38.27 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.700766 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0815  50S ribosomal protein L23P  38.16 
 
 		 81 aa  53.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  43.86 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0215  50S ribosomal protein L23  40.48 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000957762  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0322  50S ribosomal protein L23  40.48 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00637694  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1776  ribosomal protein L23  40.51 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  44.64 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0289  50S ribosomal protein L23  40.54 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0312226  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2172  50S ribosomal protein L23  39.29 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267938  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0233  50S ribosomal protein L23  39.29 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0201  50S ribosomal protein L23  39.29 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000118285  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001740  LSU ribosomal protein L23p (L23Ae)  39.29 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000423409  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00732  50S ribosomal protein L23  39.29 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0201  50S ribosomal protein L23  39.29 
 
 		 101 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000698801  unclonable  0.0000000000184888 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0196  50S ribosomal protein L23  39.29 
 
 		 101 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000848979  decreased coverage  0.000284829 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0160  50S ribosomal protein L23  38.1 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000144621  decreased coverage  0.0000412321 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4168  50S ribosomal protein L23  39.29 
 
 		 101 aa  50.1  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000463544  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3757  50S ribosomal protein L23  39.29 
 
 		 101 aa  50.1  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228479  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0202  50S ribosomal protein L23  39.29 
 
 		 101 aa  50.1  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000251497  unclonable  0.00000770372 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0198  50S ribosomal protein L23  39.29 
 
 		 101 aa  50.1  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000795974  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4054  50S ribosomal protein L23  39.29 
 
 		 101 aa  50.1  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000001282  unclonable  0.00000000000566696 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  36.26 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4688  50S ribosomal protein L23  44.26 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000001343  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0172  50S ribosomal protein L23  39.29 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243767  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1519  ribosomal protein L23  36.25 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000262554  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  40.96 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0871  50S ribosomal protein L23  39.29 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2251  50S ribosomal protein L23P  35.8 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000000299035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4315  50S ribosomal protein L23  42.62 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000209174  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  40 
 
 		 97 aa  48.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0186  50S ribosomal protein L23  36.9 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000102577  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  45.31 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  47.54 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0578  Ribosomal protein L25/L23  44.93 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  37.33 
 
 		 105 aa  47.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0315  ribosomal protein L25/L23  34.57 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.997937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0491  50S ribosomal protein L23  42.11 
 
 		 98 aa  47.8  0.00006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.98557  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 98 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5047  50S ribosomal protein L23  34.04 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185864  normal  0.262037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  44.26 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  45.45 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0108  50S ribosomal protein L23P  38.96 
 
 		 82 aa  47.4  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0150  50S ribosomal protein L23  44.26 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125205  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  44.93 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1356  ribosomal protein L25/L23  46.88 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.385939  normal  0.0499735 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  47.54 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  45.9 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  44.26 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  45.31 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3756  Ribosomal protein L25/L23  30.77 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  40.86 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  47.54 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1307  50S ribosomal protein L23  34.04 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433832  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1266  50S ribosomal protein L23  30.53 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000310284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  40.45 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  40.45 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1944  50S ribosomal protein L23  32.73 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2968  50S ribosomal protein L23  32.38 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.307651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  39.66 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03169  50S ribosomal protein L23  37.97 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000759178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0395  Ribosomal protein L25/L23  37.97 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000225919  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0395  50S ribosomal protein L23  37.97 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000080861  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  41.94 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4641  50S ribosomal protein L23  37.97 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287124  normal  0.0460173 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3613  50S ribosomal protein L23  37.97 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000847098  hitchhiker  0.00309782 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  45.9 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0330  ribosomal protein L23  43.28 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0586  50S ribosomal protein L23  39.24 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108369  normal  0.186609 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3703  50S ribosomal protein L23  37.97 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225733  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  44.62 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  44.62 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3522  ribosomal protein L25/L23  35.56 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000457129  hitchhiker  0.00000622944 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0444  50S ribosomal protein L23P  33.33 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0443463  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0083  50S ribosomal protein L23P  31.17 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.657611  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0285  50S ribosomal protein L23  39.24 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000248684  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03120  hypothetical protein  37.97 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000565358  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3913  50S ribosomal protein L23  39.24 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.78804e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3512  50S ribosomal protein L23  37.97 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000392959  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3801  50S ribosomal protein L23  37.97 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000749996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>