126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2251 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2251  50S ribosomal protein L23P  100 
 
 		 82 aa  167  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000000299035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0534  50S ribosomal protein L23P  65 
 
 		 83 aa  106  9.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.646212  normal  0.481774 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0444  50S ribosomal protein L23P  63.41 
 
 		 82 aa  104  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0443463  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0566  50S ribosomal protein L23P  59.76 
 
 		 82 aa  102  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0431079  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0083  50S ribosomal protein L23P  46.34 
 
 		 82 aa  83.6  8e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.657611  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1726  ribosomal protein L25/L23  42.68 
 
 		 82 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0108  50S ribosomal protein L23P  42.5 
 
 		 82 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0003  50S ribosomal protein L23P  40 
 
 		 82 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000337619  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0228  ribosomal protein L25/L23  42.86 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1519  ribosomal protein L23  42.86 
 
 		 87 aa  65.1  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000262554  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1830  50S ribosomal protein L23P  40.74 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.649517 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16602  Ribosomal protein L23a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  38.27 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2294  50S ribosomal protein L23P  38.75 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1585  50S ribosomal protein L23P  37.84 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0793  50S ribosomal protein L23P  35 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.110307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0031  50S ribosomal protein L23P  35 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0805  50S ribosomal protein L23P  33.75 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.720418  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0815  50S ribosomal protein L23P  39.19 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0212  ribosomal protein L23  33.75 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1125  50S ribosomal protein L23P  35 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1798  50S ribosomal protein L23P  37.84 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.217622  normal  0.590833 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2048  50S ribosomal protein L23P  35.37 
 
 		 82 aa  57  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.700766 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0859  50S ribosomal protein L23P  36.25 
 
 		 86 aa  57  0.00000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.455359  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2220  ribosomal protein L23  35.8 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0807  50S ribosomal protein L25/L23  37.8 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.563432 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0093  50S ribosomal protein L23P  37.04 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000249681  unclonable  0.000000335999 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0315  ribosomal protein L25/L23  40.54 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.997937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2447  50S ribosomal protein L23P  33.33 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08856  60S ribosomal protein L23 (AFU_orthologue; AFUA_5G05630)  42.42 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00350  ribosomal protein, putative  36.25 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0604  Ribosomal protein L25/L23  37.5 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0856  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483725  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61259  predicted protein  35.8 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  44.23 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4274  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 		 98 aa  47  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000576147  unclonable  0.00000000000382148 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2905  50S ribosomal protein L23  41.94 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000254231  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  43.08 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  41.67 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3295  50S ribosomal protein L23  35.38 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000040814  hitchhiker  0.0000223362 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1348  50S ribosomal protein L23  42.31 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2948  50S ribosomal protein L23  35.38 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000296107  hitchhiker  0.000000753496 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2172  50S ribosomal protein L23  39.62 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267938  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0325  50S ribosomal protein L23  37.74 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000118373  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1776  ribosomal protein L23  36 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl125  50S ribosomal protein L23  43.08 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058644  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  41.43 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001740  LSU ribosomal protein L23p (L23Ae)  38.89 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000423409  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00732  50S ribosomal protein L23  38.89 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3993  Ribosomal protein L25/L23  42.31 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0407  50S ribosomal protein L23  37.74 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00180319  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0215  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000957762  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3017  50S ribosomal protein L23  33.85 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000878321  decreased coverage  0.0020306 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  46.67 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0628  ribosomal protein L23  40.38 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000267442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4546  50S ribosomal protein L23  40.38 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.215144  normal  0.061023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5077  50S ribosomal protein L23  40.38 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000053863  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  51.02 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0150  50S ribosomal protein L23  38 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125205  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  43.48 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0682  50S ribosomal protein L23  40.38 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3913  50S ribosomal protein L23  35.85 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.78804e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  40 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2322  50S ribosomal protein L23  35.38 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000334931  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0586  50S ribosomal protein L23  35.85 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108369  normal  0.186609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0285  50S ribosomal protein L23  35.85 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000248684  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  40 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0289  50S ribosomal protein L23  48.98 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0312226  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  43.4 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  51.02 
 
 		 98 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  38.57 
 
 		 100 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3522  ribosomal protein L25/L23  36.67 
 
 		 99 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000457129  hitchhiker  0.00000622944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  48.28 
 
 		 94 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  45 
 
 		 98 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0322  50S ribosomal protein L23  39.62 
 
 		 100 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00637694  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3177  50S ribosomal protein L23  32.31 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000279852  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  38.57 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0694  50S ribosomal protein L23  41.67 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0172  50S ribosomal protein L23  35.19 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243767  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3315  50S ribosomal protein L23  32.31 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0760  50S ribosomal protein L23  40.3 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000631754  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1913  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.263974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  45 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4688  50S ribosomal protein L23  35.19 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000001343  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  45 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0471  50S ribosomal protein L23  39.29 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000395002  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  43.4 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0302  Ribosomal protein L25/L23  45.1 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.055916  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  40.32 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4315  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000209174  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03169  50S ribosomal protein L23  35.85 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000759178  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03120  hypothetical protein  35.85 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000565358  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0160  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000144621  decreased coverage  0.0000412321 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3907  50S ribosomal protein L23  39.22 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.104737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3613  50S ribosomal protein L23  35.85 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000847098  hitchhiker  0.00309782 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3703  50S ribosomal protein L23  35.85 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>