137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0807 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0807  50S ribosomal protein L25/L23  100 
 
 		 88 aa  178  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.563432 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0228  ribosomal protein L25/L23  50.6 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1519  ribosomal protein L23  38.1 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000262554  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0534  50S ribosomal protein L23P  37.66 
 
 		 83 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.646212  normal  0.481774 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1585  50S ribosomal protein L23P  49.33 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0566  50S ribosomal protein L23P  39.02 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0431079  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2048  50S ribosomal protein L23P  44.44 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.700766 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0815  50S ribosomal protein L23P  44 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1798  50S ribosomal protein L23P  45.33 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.217622  normal  0.590833 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0108  50S ribosomal protein L23P  42.86 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0859  50S ribosomal protein L23P  37.35 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.455359  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1726  ribosomal protein L25/L23  38.27 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2220  ribosomal protein L23  36.14 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2251  50S ribosomal protein L23P  37.8 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000000299035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1830  50S ribosomal protein L23P  35.8 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.649517 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1125  50S ribosomal protein L23P  34.52 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0444  50S ribosomal protein L23P  34.15 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0443463  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0793  50S ribosomal protein L23P  33.33 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.110307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0031  50S ribosomal protein L23P  33.33 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0083  50S ribosomal protein L23P  33.77 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.657611  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2447  50S ribosomal protein L23P  35.8 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0212  ribosomal protein L23  34.94 
 
 		 84 aa  53.5  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0962  50S ribosomal protein L23  35.56 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000402083  hitchhiker  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0003  50S ribosomal protein L23P  38.96 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000337619  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0805  50S ribosomal protein L23P  32.14 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.720418  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2294  50S ribosomal protein L23P  35.8 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  41.43 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1351  50S ribosomal protein L23  49.02 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  41.43 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2905  50S ribosomal protein L23  51.85 
 
 		 117 aa  48.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000254231  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  39.44 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  39.44 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1793  50S ribosomal protein L23  49.12 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346044  normal  0.0641385 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06270  50S ribosomal protein L23  34.48 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219554  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16602  Ribosomal protein L23a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  31.71 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  44.83 
 
 		 94 aa  47  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  48.08 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  41.51 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  48.08 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  48.08 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  38.57 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0456  50S ribosomal protein L23  37.88 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0420406  unclonable  0.000000164588 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0489  50S ribosomal protein L23  37.88 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000019112  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0486  50S ribosomal protein L23  37.88 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00438289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4747  50S ribosomal protein L23  37.88 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000334762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0423  50S ribosomal protein L23P  33.33 
 
 		 98 aa  47  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0123777  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2816  50S ribosomal protein L23  47.06 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.439693 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  49.02 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  34.48 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08870  50S ribosomal protein L23  37.29 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.679116  hitchhiker  0.00894178 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3907  50S ribosomal protein L23  36.36 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.104737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  40.58 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0839  50S ribosomal protein L23  37.29 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  40.62 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  44.07 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0315  ribosomal protein L25/L23  35.8 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.997937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  42.11 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  28.38 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1251  50S ribosomal protein L23  47.06 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.781143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61259  predicted protein  36.47 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  45.1 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  43.14 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  47.06 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  40.68 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  43.14 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  47.06 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2968  50S ribosomal protein L23  49.02 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.307651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  43.55 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  44.26 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2322  ribosomal L23 protein  35.82 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0760  50S ribosomal protein L23  50.98 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000631754  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4274  50S ribosomal protein L23  34.18 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000576147  unclonable  0.00000000000382148 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  43.14 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0933  Ribosomal protein L25/L23  40.74 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1944  50S ribosomal protein L23  49.02 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  35.63 
 
 		 94 aa  43.5  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  29.67 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0460  50S ribosomal protein L23P  29.73 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  44.44 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0267  50S ribosomal protein L23  45.1 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000129072  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08856  60S ribosomal protein L23 (AFU_orthologue; AFUA_5G05630)  36.47 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0578  Ribosomal protein L25/L23  43.14 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  37.29 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0297  ribosomal L23 protein  32.76 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000230523  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2230  50S ribosomal protein L23  39.66 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  39.22 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  43.14 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1228  50S ribosomal protein L23  45.45 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.195733  unclonable  0.00000945894 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0849  50S ribosomal protein L23P  31.88 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000828313  decreased coverage  0.0000112275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  45.1 
 
 		 97 aa  42  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  45.1 
 
 		 97 aa  42  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1681  50S ribosomal protein L23  47.06 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0570438  hitchhiker  0.0000115816 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  32.39 
 
 		 98 aa  42  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  41.43 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1356  ribosomal protein L25/L23  42.62 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.385939  normal  0.0499735 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0302  Ribosomal protein L25/L23  33.33 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.055916  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>