187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2294 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2294  50S ribosomal protein L23P  100 
 
 		 87 aa  173  7e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1830  50S ribosomal protein L23P  68.29 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.649517 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0212  ribosomal protein L23  65.43 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2447  50S ribosomal protein L23P  64.2 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2220  ribosomal protein L23  60.49 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0566  50S ribosomal protein L23P  47.5 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0431079  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1519  ribosomal protein L23  45.24 
 
 		 87 aa  75.5  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000262554  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0031  50S ribosomal protein L23P  43.53 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0793  50S ribosomal protein L23P  42.35 
 
 		 86 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.110307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1125  50S ribosomal protein L23P  42.35 
 
 		 86 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0534  50S ribosomal protein L23P  44.3 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.646212  normal  0.481774 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0859  50S ribosomal protein L23P  42.35 
 
 		 86 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.455359  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0444  50S ribosomal protein L23P  41.25 
 
 		 82 aa  69.7  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0443463  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00350  ribosomal protein, putative  46.99 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0805  50S ribosomal protein L23P  41.18 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.720418  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0228  ribosomal protein L25/L23  44.05 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0083  50S ribosomal protein L23P  40.51 
 
 		 82 aa  67.4  0.00000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.657611  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0003  50S ribosomal protein L23P  43.9 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000337619  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0108  50S ribosomal protein L23P  45.57 
 
 		 82 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16602  Ribosomal protein L23a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  38.82 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1726  ribosomal protein L25/L23  38.27 
 
 		 82 aa  63.5  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61259  predicted protein  43.37 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2251  50S ribosomal protein L23P  38.75 
 
 		 82 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000000299035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2048  50S ribosomal protein L23P  35.8 
 
 		 82 aa  51.6  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.700766 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1776  ribosomal protein L23  41.89 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1585  50S ribosomal protein L23P  36 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  41.43 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0815  50S ribosomal protein L23P  37.33 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  43.94 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0807  50S ribosomal protein L25/L23  35.8 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.563432 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1798  50S ribosomal protein L23P  34.67 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.217622  normal  0.590833 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08856  60S ribosomal protein L23 (AFU_orthologue; AFUA_5G05630)  38.75 
 
 		 153 aa  50.4  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0315  ribosomal protein L25/L23  34.88 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.997937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  45.59 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0460  50S ribosomal protein L23P  42.62 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0093  50S ribosomal protein L23P  35.14 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000249681  unclonable  0.000000335999 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  38.2 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0322  50S ribosomal protein L23  38.71 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00637694  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  49.18 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  42.42 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  49.18 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0202  50S ribosomal protein L23  36.47 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000251497  unclonable  0.00000770372 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4054  50S ribosomal protein L23  36.47 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000001282  unclonable  0.00000000000566696 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4168  50S ribosomal protein L23  36.47 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000463544  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3757  50S ribosomal protein L23  36.47 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0198  50S ribosomal protein L23  36.47 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000795974  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001740  LSU ribosomal protein L23p (L23Ae)  38.71 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000423409  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  42.86 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00732  50S ribosomal protein L23  38.71 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3907  50S ribosomal protein L23  35.62 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.104737  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0871  50S ribosomal protein L23  36.47 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0061  50S ribosomal protein L23  36.11 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000105028  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  51.85 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0201  50S ribosomal protein L23  35.29 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000118285  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  42.42 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  49.18 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  37.88 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0233  50S ribosomal protein L23  35.29 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  49.18 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  37.36 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  41.77 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2322  50S ribosomal protein L23  38.37 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000334931  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0201  50S ribosomal protein L23  35.29 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000698801  unclonable  0.0000000000184888 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0196  50S ribosomal protein L23  35.29 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000848979  decreased coverage  0.000284829 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0215  50S ribosomal protein L23  37.65 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000957762  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  35.14 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  36.96 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  44.12 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  35.23 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  48.21 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0172  50S ribosomal protein L23  36.47 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243767  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  45.9 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2172  50S ribosomal protein L23  37.1 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267938  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04000  50S ribosomal protein L23  35.48 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0186  50S ribosomal protein L23  38.71 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000102577  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  46.67 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  41.77 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0586  50S ribosomal protein L23  37.1 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108369  normal  0.186609 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4688  50S ribosomal protein L23  36.47 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000001343  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0285  50S ribosomal protein L23  37.1 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000248684  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  40.35 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3913  50S ribosomal protein L23  37.1 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.78804e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  35.16 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0150  50S ribosomal protein L23  35.29 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125205  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0160  50S ribosomal protein L23  35.29 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000144621  decreased coverage  0.0000412321 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  45 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  42.65 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  43.94 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  42.65 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4542  50S ribosomal protein L23  37.5 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000172317  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0107  50S ribosomal protein L23  38.24 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000207631  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0106  50S ribosomal protein L23  39.71 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000244838  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4315  50S ribosomal protein L23  38.71 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000209174  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  38.2 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 		 103 aa  43.5  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 		 103 aa  43.5  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2905  50S ribosomal protein L23  42.62 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000254231  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4641  50S ribosomal protein L23  37.5 
 
 		 100 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287124  normal  0.0460173 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0281  50S ribosomal protein L23  36.47 
 
 		 102 aa  43.5  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000926616  hitchhiker  0.00000149946 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>